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Journal Cover Acta Biologica Colombiana
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   ISSN (Print) 0120-548X - ISSN (Online) 1900-1649
   Published by Universidad Nacional de Colombia Homepage  [23 journals]
  • Zooplankton Responses in a Tropical System (La Chapa Reservoir,
           Colombia) with Environmental Stress

    • Abstract: Los procesos de transformación ambiental que se dan en la actualidad en un marco de cambio climático, generan modificaciones en los ecosistemas y comunidades biológicas, ?cómo responden las poblaciones a estos factores de tensión?, ?qué efectos se darían sobre la diversidad taxonómica y ecológica? Se analizó la variación de la composición taxonómica y estructura del zooplancton en función de los cambios ambientales en un reservorio tropical ubicado a 6° 02' 18" N y 73° 29' 16" O. Semanalmente se realizaron muestreos en la zona limnética del sistema durante cuatro meses que abarcaron los periodos seco, de transición y de alta precipitación. Se estableció un alto grado de variabilidad temporal asociada al poco tiempo de retención hidráulica estimado en ocho días. Se registraron nueve especies en el zooplancton, entre ellas Keratella tropica tropica y Thermocyclops decipiens que fueron las más abundantes y constantes. Los valores de diversidad H' y riqueza S hallados se consideran bajos, lo que corresponde a una comunidad poco madura vinculada a un ambiente físico fluctuante, evidenciado en los elevados coeficientes de variación de la conductividad eléctrica y la transparencia Secchi. La fluctuación del volumen del sistema en lapsos cortos de tiempo, genera cambios significativos en la expresión física del sistema con efecto directo sobre la composición y estructura del zooplancton. En general el modelo de respuesta del zooplancton en este reservorio, se ajusta a los supuestos de la hipótesis de disturbio intermedio.Processes of environmental transformation that currently occur in the climatic change context generate changes in ecosystems and biological communities. ?how populations respond to these stressors? ?what effects could occur on taxonomic and ecological diversity? The taxonomic composition and structure of the zooplankton was analyzed with relationship to environmental changes in a tropical water reservoir located at 6° 02' 18" N and 73° 29' 16" W. During four months, samples were taken weekly covering stations of low, medium, and high precipitation. A high degree of temporal variability was established, it associated with a short hydraulic retention time estimated at eight days. Nine species of zooplankton were collected, of which Keratella tropica tropica and Thermocyclops decipiens were the two most abundant and constant species. Found values of H' diversity and S richness were considered low, corresponding to a little mature community associated with a fluctuating physical environment and supported by high variation coefficients of electrical conductivity and Sechhi disk transparency. Drastic variations on the system volume in short time lapses generate important changes in the physical expression of system with a direct effect on composition and structure of the zooplankton. In general, the response model of the zooplankton in the reservoir according to the statement by the intermediate disturbance hypothesis.
  • Evaluation of Ethylene Glycol as a Cryoprotectant in the Sperm
           Cryopreservation of Trans-Andean Shovelnose Catfish (Sorubim
    , Pimelodidae)

    • Abstract: Se evaluó el semen crioconservado de Sorubim cuspicaudus utilizando etilenglicol (ETG) a tres niveles de inclusión (5, 10, 15 %). Machos (n = 13) en fase de espermiación y hembras (n = 6) en maduración final se indujeron con 0,4 ml de Ovaprim®/Kg, después de 12 a 14 horas post-inducción se colectó el semen en viales Eppendorf de 2 ml de capacidad. Las diferentes soluciones crioprotectoras se prepararon con glucosa 6 % (p/v), leche en polvo descremada 5 % (pv) y agua destilada. El semen fue diluido en proporción 1:3 (semen:diluyente), empacado en macrotubos de 2,5 ml y congelado en vapores de nitrógeno líquido (NL) durante 30 minutos y luego almacenados en termos criogénicos sumergidos directamente en NL (- 196°C). El semen crioconservado fue descongelado en baño serológico a 35°C durante 90 segundos. La movilidad total, progresividad y velocidad espermática del semen fresco y descongelado se analizó con el software Sperm Class Analizer SCA® (Microptic SL, España). La fertilidad y eclosión se evaluó con 1,0-1,5 g de ovocitos en incubadoras experimentales de flujo ascendente de dos litros de capacidad. Se utilizó un diseño completamente aleatorizado. El semen fresco registró tasa de eclosión de 51,8°21 %, sin observarse diferencia significativa con la obtenida con el semen crioconservado con ETG 5 % (38,6 ° 13,9 %) (p> 0,05); mientras que ETG 15 % (9,6 ° 2,9 %) reportó la menor eclosión (p < 0,05). Los resultados sugieren que la solución crioprotectora compuesta por ETG 5 %, glucosa 6 % y leche en polvo 5 % es una alternativa viable para la crioconservación de semen de Sorubim cuspicaudus con fecundaciones similares al usar semen fresco.The catfish Sorubim cuspicaudus cryopreservation semen was evaluated using three levels (5, 10, 15 %) of ethylene glycol (ETG). Males (n = 13) undergoing spermiation and in final maturation females (n = 6) were induced with 0.4 ml Ovaprim®/Kg, after 12 and 14 post-induction the semen was collected in 2 ml Eppendorf vials. The different cryoprotectants solutions were prepared with glucose 6 % (w/v) skimmed milk powder 5 % (w/v) and distilled water. The semen was diluted in ratio 1:3 (semen:extender), packed in macrotubes of 2.5 ml and frozen in liquid nitrogen (NL) vapor for 30 minutes, then the macrotubes were stored in cryogenic tanks submerged directly in NL (-196°C). The sperm were thawed in serological bath to 35°C for 90 seconds. The total motility, total progressivity and velocities in fresh and thawed semen were analyzed with the Sperm Class Analyzer software SCA® (Microptic SL, Spain). Fertility and hatching rates were assessed with 1.0-1.5 g of oocytes in experimental up flow incubators two liters, a completely randomized design was used. The hatching rate of fresh semen was 51,8°21 %, with no significant differences with semen cryopreserved with ETG 5 % (38.6 ° 13.9 %) (p> 0,05), while ETG 15 % (9.6 ° 2.9 %), recorded the lower hatching rate (p < 0.05). The results suggest that the cryoprotectant solution composed of ETG 5 %, glucose 6 % and powdered milk 5 % is a viable alternative for semen cryopreservation of the catfish Sorubim cuspicaudus.
  • Population Assessment and Degree of Threat of Chalybea
    (Melastomataceae) Endemic Species from Colombia

    • Abstract: Se presentan los resultados de la evaluación poblacional de Chalybea macrocarpa, considerada En Peligro (EN) por su área de distribución restringida, presión generada por cultivos y ganadería extensiva. El estudio se realizó en el departamento de Boyacá (Colombia), en el municipio de Arcabuco, en tres localidades establecidas con información de herbario y bibliografía; con trabajo de campo se identificó la distribución, densidad y fenología como subcriterios para delimitar el área de extensión de presencia y de ocupación de la misma. Se tomaron datos estructurales (altura, cobertura y DAP) para determinar las clases de edades de la población. Con la información recopilada y de vegetación asociada, se re-categorizó la especie bajo el criterio B de la UICN. Se distribuye hacia el noroccidente y sur de Arcabuco, en un área de extensión de 59,9 km2, de ocupación 4 km2, y una densidad poblacional de 50 individuos/km2. La floración y fructificación es continua en el año, sin embargo, la mayor floración es de marzo a agosto y la fructificación de septiembre a febrero. La estructura por edades, permitió identificar diez clases entre plántulas, juveniles y adultos. La población está representada por pocos individuos de plántulas (10,6 %) y juveniles (20,9 %), comparado con adultos (68,5 %). Finalmente, dadas las condiciones actuales de la población de C. macrocarpase propone la recategorización del riesgo de extinción En Peligro Crítico (CR B1ab (iii)).Population assessment results from Chalybea macrocarpaare shown, the specie is considerate ENDANGERED (EN) by its restricted area, threatened is generated by crops and extensive cattle farming. The study was conducted in the Boyacá department (Colombia), municipality of Arcabuco, in three established localities using herbarium and literature information; field work made possible identified distribution, density and phenology like sub criteria, allowing identify the presence extension and occupancy area. We took structural data (height, coverage and DBH) to determinate the population age's classes. Whit the gathered information and the associated vegetation, the specie is re-categorized with the B IUCN criteria. It is distributed to the northwest and southern in Arcabuco, in an area of 59.9 km2, 4 km2 of occupancy and a population density of 50 individual/km2. Flowering and fruiting is continuous through the year, however, most of the flowering is from March to August and fruiting from September to February. Age structure allows identified ten species between seedlings, juveniles and adults. Population is represented by few seedling individuals (10.6 %) and juveniles (20.9 %) versus adults (68.5 %). Finally, C. macrocarpais upgraded to Critical Risk (CR B1ab (iii)).
  • Performance of Seeds Crambe Exposed to Pre-germination Treatments

    • Abstract: Com o estímulo à produção e uso de biodiesel, sementes de crambe constituem hoje uma das melhores opçõ es para o fornecimento de matéria-prima, sendo também excelente alternativa para cultivo de outono-inverno visando rotação de culturas. O objeto deste estudo foi avaliar o efeito da combinação de tratamentos de pré-germinação sobre o comportamento de sementes de crambe. A partir de um lote de sementes da cultivar FMS Brilhante, foi proposto o delineamento experimental inteiramente casualizado, em esquema fatorial 2 x 5. O delineamento foi baseado na combinação de duas condiçõ es estruturais: sementes com e sem pericarpo, e ambas submetidas a tratamentos pré-germinativos com e sem ácido giberélico, sendo: testemunha (sem tratamento); sementes pré-embebidas em água destilada sem adição de giberelina por 24 horas como controle; e sementes préembebidas em solução de ácido giberélico a 4 %, em diferentes concentraçõ es (400; 500 e 600 mg.L-1). Determinou-se o teor de água, primeira contagem de germinação, porcentagem de germinação, emergência de plântulas e índice de velocidade de emergência. Diante dos resultados conclui-se que a retirada do pericarpo em sementes de crambe, cultivar FMS Brilhante, acelera a velocidade de germinação, porém, diminui a sua porcentagem final. A pré-embebição em ácido giberélico (400, 500 e 600 mg.L-1) por 24 horas proporcionou incrementos na germinação e no vigor das sementes de crambe com pericarpo.Encouraging the production and use of biodiesel, seeds of crambe today constitute one of the best options for the supply of raw material, is also an excellent alternative for autumn-winter crop rotation order. The aim of this study was to evaluate the efficiency of combined pre-germination treatments on the seed behavior of crambe. From a seed sample of FMS Brilhante cultivar, an experimental design completely randomized with a 2 x 5 factorial arrangement was performed. It was formed from combination of two structural conditions, seeds with or without pericarp, and treatments with or without giberelic acid, being: control (no treatment); seeds pre-soaked in distilled water for 24 hours as control; and seeds pre-soaked in gibberellic acid at 4 % at different concentrations (400, 500 and 600 mg.L-1). Water content, first count germination, germination, seedling emergence and emergence rate index were determined. From these results it is concluded that removal of the pericarp in seed of crambe, cultivar FMS Brilhante, accelerated the germination rate, however, decreased your final percentage. The pre-soaking in gibberellic acid (400, 500 and 600 mg L-1) for 24 hours, increased the germination and seed vigor crambe with pericarp.Como un estímulo a la producción y uso del biodiesel, las semillas de crambe constituyen hoy una de las mejores opciones para el suministro de materia prima, también son una excelente alternativa en la rotación de cultivos de otoã±oinvierno. El objetivo de este estudio fue evaluar la eficiencia de la combinación de tratamientos pre-germinativos sobre el comportamiento de semillas de crambe. A partir de una muestra de semillas del cultivar FMS Brilhante, se propuso un diseã±o experimental completamente aleatorizado, con un esquema factorial 2 x 5. El diseã±o se basó en la combinación de dos condiciones estructurales: semillas con y sin pericarpio, y ambos sometidos a tratamentos pre-germinativos con y sin ácido giberélico, siendo: control (sin tratamiento); semillas pre-embebidas en agua destilada sin giberelina por 24 horas como control; y semillas pre-embebidas en solución de ácido giberélico a 4 %, en diferentes concentraciones (400; 500 e 600 mg.L-1). Se determinó el contenido de agua, primer contaje de germinación y porcentaje de germinación, emergencia de plántulas e índice de velocidad de emergencia. A partir de estos resultados se concluye que la remoción del pericarpio en semillas de crambe, cultivar FMS Brilhante, aceleró la velocidad de germinación, pero, disminuyó su porcentaje final. La pre-imbibición en ácido giberélico (400, 500 e 600 mg.L-1) por 24 horas proporcionó incrementos en la germinación y en el vigor de las semillas de crambe con pericarpio.
  • Social Organization of a Colony of Bats Carollia brevicauda in
           Artificial Shelter, Bochalema, Norte de Santander, Colombia

    • Abstract: Se estudió la organización social de una colonia del murciélago frugívoro Carollia brevicauda en un refugio artificial en Bochalema, Norte de Santander, Colombia. Empleando un nuevo tipo de marcaje que consiste en decoloración capilar y mediante muestreos focales se observó la colonia desde septiembre de 2007 a septiembre de 2008. Se determinó que esta es definida por cuatro grupos los cuales no variaron en su conformación a lo largo del tiempo. Se estableció que las hembras fueron más fieles al refugio que los machos. Se evaluó el presupuesto de tiempo diurno y se registró que los individuos tienen un 73,9 % de tiempo en reposo, seguido del acicalamiento con un 26,6 % y las hembras presentaron mayor actividad que los machos sobre todo en época seca. Se determinaron diferencias en registros entre C. brevicauda y C. perspicillata, como por ejemplo la fidelidad de las hembras al refugio.We studied the social organization of a colony of the fruit bat Carollia brevicauda in an artificial shelter in Bochalema, Norte de Santander, Colombia. Using a new type of marking and by focal sampling, one colony was observed from September 2007 to September 2008. It was determined that the social structure in the colony was integrated by four groups, which did not vary in structure over time. It was established that females were more faithful to the shelter than males. We assessed time budget dayly and there was that individuals hadx a 73.9 % time without any activity, followed by grooming with a 26.6 %, and females had higher activity than males, especially in dry season. We found that C. brevicauda has differences with records of C. perspicillata such as the fidelity of females and non-influence of lunar light over the hour of emergence from the refuge.

    • Abstract: Despite the condition of leaf-cutting ant pests in agroecosystems, it is undeniable the benefits they can bring in certain situations or environments. The leaf-cutting ants of the genus Acromyrmex attack mainly leaves of vegetables and fruit trees exposing not only to the agrochemicals used for their control as well as to those used for the control of other pests. Due to the bioindicator potential of environmental quality of the ants and their frequent exposure to agrochemicals such as organophosphates, neonicotinoids and growth regulators insecticide used for pest control, it is necessary to study the sublethal effects that these pesticides may cause. The electrophoresis technique was used to study the activity of esterase isozymes involved in the metabolism of xenobiotics of A. niger , combined with changes in the expression of isozymes after contamination by pesticides. A. niger showed eight regions of esterase activity, which were called EST-1, EST-2, EST-3, EST-4, EST-5, EST-6, EST-7 and EST-8 according to the electrophoretic mobility. As the specificity to ± and b-naphthyl acetate substrates, the Est- 7 and Est-8 may be ified as ±-esterase and the others as ±b esterases. EST-5 is considered an enzyme of the type cholinesterase II and the others are of the type carboxilesterase. The electrophoretic analysis showed partial inhibition to all esterases subjected to the contact with Malathion organophosforate at the concentrations 1 x 10-3 % and 5 x 10-3 %, which may be considered as a biomarker for the presence of residues of this insecticide in the environment. The regression analysis for sublethal effects of the tested pesticides demonstrated correlation between dose and mortality only for Thiametoxam neonicotinoid pesticide.A pesar de la condición de plaga de las hormigas cortadoras en agroecosistemas, no se pueden negar los beneficios que ellas pueden traer en determinadas situaciones o en determinados ambientes. Las hormigas cortadoras del género Acromyrmex atacan principalmente las hojas de hortalizas y hojas de plantas fructíferas, exponiéndose no solo a los agroquímicos utilizados para su control sino también a aquellos utilizados en el control de otras plagas. Debido al potencial bioindica-dor de la calidad ambiental de las hormigas y su frecuente exposición a los agrotóxicos como organofosforados, neonicotinoides y reguladores de crecimiento, utilizados en el control de plagas, es necesario el estudio de los efectos subletales que estos agrotóxicos pueden causar. La técnica de electroforesis fue utilizada para evaluar la actividad de las isoenzimas esterasas involucradas en el metabolismo de xenobióticos de A. niger , asociada a las alteraciones en la expresión de las isoenzimas después de la contaminación con pesticidas. Acromyrmex Niger demostró ocho regiones de actividad esterasa, las cuales fueron denominadas EST-1, EST-2, EST-3, EST-4, EST-5, EST-6, EST-7 e EST-8 de acuerdo con la movilidad electroforética. En cuanto a la especificación de los substratos ± y b-nafitl acetato, las EST-7 e EST-8 son clasificadas como ±- esterasa y las demás ±b esterasas. EST-5 es considerada una enzima del tipo colinesterasa II y las demás son carboxilesterasas. El análisis electroforético presentó inhibición parcial para todas las esterasas sometidas al contacto con malathion en las concentraciones 1 x 10-3 % e 5 x 10-3 %, que puede ser considerado un biomarcador para la presencia de residuos de este insecticida en el ambiente. El análisis de regresión para el efecto subletal de los pesticidas evaluados demostró correlación entre la dosis y la causa de muerte solo para el pesticida neonicotinoide thiametoxam
  • Use of Non Vascular Plant Organisms as Indicators of Urban Air
           Pollution (Tunja, Boyacá, Colombiano)

    • Abstract: Los líquenes y briófitos son organismos útiles en la determinación de la calidad del aire. En la ciudad de Tunja (departamento de Boyacá, Colombia), es evidente la escasez de zonas verdes por el aumento en las construcciones, lo que contribuye al detrimento de la pureza atmosférica y trae consigo el deterioro de la salud de la ciudadanía y la reducción de los hábitats y poblaciones de las plantas criptógamas. Mediante la determinación del índice de Pureza Atmosférica (IPA) se identificaron las zonas con mayor influencia de contaminantes del aire. Parmotrema austrosinense corresponde a la especie más frecuencia; y la estación de la Normal Femenina, con IPA de 52,2196 es influenciada por los contaminantes atmosféricos; las estaciones de los Parques Santander y Semáforos son las más contaminadas (IPA 8,5333) con solo dos especies (Heterodermia albicans y Lobariaceae sp.). Se destaca la evaluación en la Reserva Forestal Protectora El Malmo con un IPA de 34,0281 y 23 especies. Los valores de IPA se agruparon en zonas de isocontaminación para ser representados cartográficamente. El uso de organismos bioindicadores es una estrategia natural y económica que permite zonificar las urbes y enfocar planes para revegetalización de ciudades, generando la disminución del impacto de contaminantes en el aire con el fin de mejorar la calidad de vida de los pobladores.Lichens and bryophytes are useful organisms in air quality determination. In the city of Tunja (Boyacá, Colombia), is evident the lack of green areas by the increase of building, which contributes to the detriment of the atmospheric purity making unhealthy conditions to the citizens and habitats and population reduction of cryptogamic plants. Using the Index of Atmospheric Purity (IAP) we identified the greater influence air pollutants areas. Parmotrema austrosinense has the highest frequency; and the Normal Femenina station with an IAP of 52,2196 is an atmospheric pollutants influenced area; Parque Santander and Semáforos, are the most contaminated (IAP 8,5333) with only two species (Heterodermia albicans and Lobariaceae sp.). We highlight the evaluation in the Reserva Forestal Protectora El Malmo with an IAP of 34,0281 and 23 species. IAP values were grouped in isocontamination areas to be represented cartographically. The use of bioindicators organisms is a natural and economic strategy allowing us to mapping urban areas and make revegetation cities designs, generating the contaminants diminution air impact improving the citizen's life quality.
  • Effects of Light Intensity and Fertilization on the Growth of Andean
           Oak Seedlings at Nursery

    • Abstract: Quercus humboldtii es una especie vegetal nativa de mucha importancia en Colombia por su uso en repoblamiento forestal y restauración de tierras altoandinas degradadas. La especie se encuentra fuertemente amenazada y es necesario establecer programas de propagación de la misma. Sin embargo, poco se conoce sobre sus exigencias nutricionales y lumínicas. El objetivo de este estudio fue determinar los efectos simples y combinados de la iluminación relativa (IR) y la fertilización sobre el crecimiento de plántulas de Q. humboldtii en vivero. Para esto se establecieron en combinación tres condiciones contrastantes de iluminación relativa (alta, media y baja IR) y nueve tratamientos de fertilización: completa (TC), con un elemento faltante (-N, -P, -K, -Ca, -Mg, -S, -B) y un testigo sin fertilización (T0). La condición de IR media presentó el mejor desarrollo de las plántulas. Todos los tratamientos con deficiencias nutricionales produjeron disminuciones en el desarrollo de las plántulas con respecto a TC, excepto en el tratamiento -B. El N fue el elemento más limitante, con rendimientos similares a los del tratamiento testigo. El orden de limitación que produjeron los tratamientos aplicados siguió la secuencia: T0,-N > -Ca, -K, - P > -Mg, -S > TC,-B. No se detectó interacción significativa IR x Fertilización sobre el desarrollo de las plántulas.Quercus humboldtii is a native plant species of great importance in Colombia for use in reforestation and restoration of degraded Andean highlands. The species is highly threatened and it is necessary to establish programs of propagation and planting. However, little is known about their nutritional and light requirements. The aim of this study was to determine the effects of single and combined relative illumination (IR) and fertilization on the growth of seedlings of Q. humboldtii at nursery. For this purpose three contrasting IR regimes (high, medium, and low IR) and nine fertilization treatments were established: complete (TC), a missing nutrient (-N,-P,-K,-Ca,-Mg, -S,-B) and a control without fertilization (T0). The best development of seedlings was showed in the medium IR condition. All treatments with a lacking nutrient showed decreases in seedling development regarding TC, except in the -B treatment. Nitrogen was the most limiting nutrient yielding biomass similar to that of T0. The impact of nutrient limitation on seedling performance was in the following order:-N>-Ca,-K,-P>-Mg,-S>-B. No significant interaction IR x Fertilization was detected on seedling development.
           IN SUGARCANE

    • Abstract: The objective of this work was to induce direct somatic embryogenesis from segments of immature leaves of the RB872552 variety of sugarcane and to correlate this morphogenic event with oxidative stress. Two previously described protocols were utilized for the induction of somatic embryogenesis in sugarcane with different supplementations of the culture medium and different incubation conditions. For the conversion of embryos into plants was used MS medium without phytoregulators. Histological analyses and activity of antioxidant enzymes were also conducted for the embryogenic and non-embryogenic tissues. The formation of somatic embryos was obtained in 81 % of the explants with the combination of regulators 2,4-D (2,4-dichlorophenoxyacetic acid)and BAP (6-benzylaminopurine) when incubated under 16 h photoperiod. With regards to the antioxidant enzymes, there was increased activity of peroxidase and an increase in the soluble protein content in embryogenic tissues, whereas lower activities of polyphenol oxidase and catalase appeared in these tissues compared to nonembryogenic tissues. It could be inferred that oxidative stress plays an important role in the induction of somatic embryogenesis in sugarcane.El objetivo de este trabajo fue inducir la embriogénesis somática directa en segmentos de hojas jóvenes en la variedad de caña de azúcar RB872552, e investigar la correlación de este evento morfogénico con el estrés oxidativo. Se utilizaron dos protocolos de inducción de embriogénesis somática, previamente descritos para caña de azúcar, con distintas suplementaciones en el medio de cultivo y en las condiciones de incubación. Para la conversión de embriones en plantas se utilizó el medio MS sin fitoreguladores. Se realizaron además análisis histológicas y de actividad enzimática antioxidante en tejidos embriogénicos y no embriogénicos. La formación de embriones somáticos ocurrió en 81 % de los explantes, con la combinación de los reguladores de crecimiento 2,4-D (ácido 2,4-diclorofenoxiacético) y BAP (6-bencilaminopurina) e incubación bajo un fotoperiodo de 16 h. Respecto a las enzimas antioxidantes, se observó un incremento en la actividad de peroxidasa y en el contenido de proteínas solubles en los tejidos embriogénicos, mientras que la polifenoloxidasa y la catalasa presentaron valores más bajos de actividad en estos tejidos, en comparación con los no embriogénicos. Se podría inferir que el estrés oxidativo juega un papel importante en la inducción de la embriogénesis somática en caña de azúcar.
  • Descriptions of the Larvae of Two Species of Paranomala and One
           Species of Strigoderma (Coleoptera: Melolonthidae: Rutelinae) from
           Puebla, Mexico

    • Abstract: Se presentan las descripciones de la larva de tercer estadio de Paranomala flavilla (Bates), P. hoepfneri (Bates) y Strigoderma costulipennis Bates, recolectadas en el estado de Puebla, México, en suelos con cultivo de amaranto (Amaranthus hypochondriacus L.). Se incluyen ilustraciones distintivas y comentarios sobre las diferencias con las larvas de otras especies de los géneros estudiados en México.The third instar larvae of Paranomala flavilla (Bates), P. hoepfneri (Bates) and Strigoderma costulipennis Bates, collected in Puebla, Mexico, in soils cultivated with amaranth are described. Illustrations of the diagnostic structures and comments on the differences with other larvae of the genera studied in Mexico are included.
  • Maturity Stages of Pink Shrimp Farfantepenaeus notialis
           (Penaeidae) in the Colombian Caribbean

    • Abstract: El camarón rosado Farfantepenaeus notilais, es uno de los recursos de mayor importancia socioeconómica en la región Caribe. Sin embargo, esta especie ha sido sobreexplotada en las últimas décadas y hay una carencia en la información biológica y pesquera. El objetivo del presente estudio es determinar y caracterizar los estadios de madurez en el campo macroscópico y microscópico del camarón de aguas someras (F. notialis) como insumo para su manejo. Las muestras fueron tomadas entre junio del 2012 y mayo del 2013, en embarcaciones camaroneras en el Caribe colombiano. Las hembras de F. notialis fueron identificadas y conservadas para el análisis histológico y se fijaron algunas de las gónadas. Se tomaron datos de talla, peso y sexo. Se determinó su estadio gonadal a partir de la morfología y coloración de la gónada, para la determinación microscópica se realizaron cortes histológicos de las muestras de 30 gónadas de todos los estadios. Se obtuvo una muestra de 3019 hembras, para las cuales se encontraron y describieron cinco estadios de desarrollo gonadal. Los resultados macroscópicos se corroboraron con los resultados del análisis de desarrollo de los ovocitos en el campo microscópico. El desarrollo de los ovocitos estuvo acorde a lo registrado para F. brevirostris en el Pacífico colombiano y F. paulensis en la costa norte de Brasil. Estos resultados son un aporte de gran importancia, porque son una guía para los administradores del recurso y la comunidad científica para la determinación de la madurez de F. notialis en el Caribe colombiano.The pink shrimp Farfantepenaeus notialis is one resource of great socioeconomic importance in the Caribbean region. However, this species has been overexploited in the last decades and there is a lack of biological and fishery information. For such reason, the objective of the present study is to determine and characterize the maturity stages a macroscopic and microscopic level of the pink shrimp (F. notialis) as input for its management. The samples were taking from June of 2012 and May 2013, on board shrimp commercial vessels in the Colombian Caribbean. The females of F. notialis were identified and preserved for the histologic analysis and some gonads were fixed. Data of size, weight and sex were taken. The gonadal stages were determined from the morphology and coloration of gonad and to microscopic determination were carried out histologic cut from samples of thirty gonads from all stages. A total of 3019 females were obtained from F. notialis, to which five stages of gonadal development were found and described. The macroscopic results were corroborated with the analysis ovocyte development a microscopic level. The development of ovocyte was coherent to that reported for F. brevirostris in the Colombian Pacífic and F. paulensis in the north coast of Brazil. These results are a contribution of the great scientific importance to the determination of maturity of F. notialis in the Colombian Caribbean.
  • Combined Action of Sex Pheromone and Wasp Apanteles
    in Greenhouse Tomato Crops

    • Abstract: El cogollero del tomate, Tuta absoluta, es considerado plaga principal del cultivo de tomate. Su control se realiza con químicos, aunque existen otros tipos de control como el biológico y etológico. En Colombia no existe ningún precedente que involucre la acción combinada de estrategias de control etológico incluyendo feromona sexual y biológico con Apanteles gelechiidivoris para el control de la plaga en cultivos de tomate. En este trabajo, se evaluaron cuatro tratamientos bajo condiciones de invernadero que incluyen control biológico con A. gelechiidivoris, etológico con trampas de feromona sexual, acción combinada de ambos controles y convencional (químico), con el objetivo de desarrollar una estrategia de control de T. absoluta a través de la acción combinada de control etológico con feromona sexual y biológico. Se realizó un muestreo sistemático, tomando una planta cada 2 m. En cada planta se tomó una hoja por estrato, semanalmente se registró el número de larvas totales, de tercer instar y parasitadas, y número de adultos capturados por trampa. El máximo parasitismo en la población de larvas susceptibles fue del 86,38 % y de la población de larvas totales 68,75 %. Se encontró que la acción combinada presenta una mayor efectividad y permanencia a través del tiempo para el control de larvas de T. absolutaThe tomato budworm, Tuta absoluta, is considered main pest of tomato crops. Control of this pest is performed with hemicals, although, there are other strategies such as biological and ethological control. In Colombia there is not precedent that combines both strategies: ethological control with sexual pheromone and biological control with Apanteles gelechiidivoris, for the control of this pest in tomato crops. In this work four different treatments under greenhouse conditions were evaluated including biological control with A. gelechiidivoris, ethological control with sexual pheromone traps, combined action of both controls and traditional control (Chemicals). The experiments aimed to developing a control strategy to reduce populations of T. absoluta. This was done sampling a plant every to 2 meters. From each plant a sample composed by one leaf by stratum was taken and the variables number of total larvae of third instar and parasited and number of captured adults for trap. The maximum parasitism in the population of susceptible larvae was 86.38 % and for total population of larvae was 68.75 %. The combined action of pheromone traps and A. gelechiidivoris presented a greater efficiency and permanence on the control of larvae of T. absoluta.

    • Abstract: Anolis auratus is a widely distributed species, from Costa Rica in Central America, through northern South America, including Colombia, Venezuela, northern Brazil, Surinam and the Guyanas. In Colombia, its widespread distribution across different life zones suggests that these lizards occupy different environments and exhibit different microhabitat use in different geographic areas. On the other hand, some observations suggest that this species prefers open areas, selecting grasslands over brushy areas, and thus, an alternative hypothesis is that microhabitat use is similar among different populations. In Anolis, body variables related to locomotion (body size and shape) define structural microhabitat use, so two distinct patterns could be expected in this species: conservative or highly variable body size and shape throughout the species distribution. To test these predictions, we characterized geographic variation in morphometric traits of this species in Colombia. Females and males were similar in body size, but exhibited differences in some variables related to body shape. These characteristics also varied among males and females from different regions, suggesting heterogeneous use of structural microhabitat, between sexes and among populations. As an alternative, phylogenetic divergence among populations could also account for the observed differences. Absence of ecological and phylogenetic data limits our ability to identify the underlying causes of this pattern. However, we provide a general framework to explore hypotheses about evolution of body size and shape in this species.Anolis auratus se distribuye desde Costa Rica en Centro América, el norte de Sur América, incluyendo Colombia, Venezuela, norte de Brasil, Surinam y las Guyanas. En Colombia, su amplia distribución en distintas zonas de vida sugiere que estos lagartos ocupan distintos ambientes, y por tanto, posiblemente exhiben variación geográfica en el uso de microhabitat. Por otra parte, algunas observaciones sugieren que estos lagartos prefieren zonas abiertas, seleccionando pastizales y por tanto, una hipótesis alternativa es que usan el mismo microhabitat en toda su distribución. En Anolis, las variables corporales relacionadas con el movimiento (tamaño y forma corporal) definen el uso del microhabitat, así que pueden esperarse dos patrones en esta especie: tamaño y forma corporal conservativos o altamente variables a lo largo de su distribución. Caracterizamos la variación geográfica en variables morfométricas de esta especie en Colombia. Hembras y machos mostraron tamaño corporal similar, pero fueron distintos en la forma del cuerpo. La forma corporal varía también en machos y hembras de distintas regiones, sugiriendo un uso heterogéneo del microhabitat estructural. Como alternativa, la divergencia filogenética entre poblaciones podría explicar las diferencias observadas. La ausencia de datos ecológicos y filogenéticos para la especie limita las hipótesis sobre causas de este patrón. Proveemos un marco general para explorar hipótesis que expliquen la evolución de tamaño y forma corporal en esta especie.
  • Composition Patterns of Waterbirds from La Vieja River, Geographic
           Valley of Cauca River, Colombia

    • Abstract: Compilamos y analizamos los datos de observaciones realizadas entre los años 2001 y 2013 en tres sectores a lo largo del cauce del río La Vieja, ubicado en el valle geográfico del río Cauca, Colombia. Describimos los datos espacial y temporalmente, enfocándonos en identificar patrones de composición y abundancia de especies. Registramos 28 especies de aves acuáticas en 33 transectos, siendo 22 especies observadas en más del 50 % de los transectos. Las diferencias en el número de especies por transecto no fueron significativas entre los tres sectores del río. Sin embargo, dos análisis de agrupamiento, considerando tanto los datos de presencia/ausencia como de abundancia, indicaron que la composición de especies presenta estructura espacial a lo largo del río. En contraste, aunque las observaciones se realizaron durante más de diez años no se encontró evidencia de cambios temporales en la composición de especies. No obstante, algunas especies mostraron tendencias de aumento o disminución en su frecuencia. Presentamos el nuevo registro de una especie (Chloroceryle aenea) para la región. A pesar de que el paisaje asociado al río La Vieja ha sufrido un gran impacto antropogénico, aún conserva una diversidad significativa de aves acuáticas que pueden servir para aportar valor a los planes de conservación en la zona.We compiled and analyzed data gathered from observations during the period 2001-2013 in three sectors along La Vieja river, located in the Cauca river valley, Colombia. We describe spatial and temporal aspects of such dataset, focusing in indentify patterns of species' composition and abundance. We recorded 28 waterbird species in 33 transects, being 22 species observed in more than 50 % of these transects. The species richness among transects did not shows significant differences. However, two cluster analyses, considering both presence/absence and abundance data, showed that there is spatial structure in the species composition along the river. In contrast, although observations were conducted during more than ten years there is no evidence of temporal changes in species composition. Still, some species showed increase or decrease trends in their frequency. We present a new record for one species (Chloroceryle aenea) for the region. Despite that the landscape surrounding La Vieja river have faced a high anthropogenic impact, the river still presents a significant diversity of waterbirds, which could add value to the conservation plans in the zone.
  • RNA-Seq Data Analysis in Prokaryotes

    • Abstract: La secuenciación de transcritos con RNA-Seq es hoy en día una de las técnicas más populares en los estudios transcriptómicos. Relativamente reciente, esta técnica ha permitido la secuenciación de transcritos de RNA en una escala y profundidad no alcanzada por otras técnicas anteriores. Sin embargo, el alcance de las conclusiones que se pueden sacar depende estrictamente de un proceso adecuado, desde el diseño experimental hasta el análisis bioinformático de los datos. Dadas las diferencias en el proceso transcripcional de las células eucariotas y procariotas, el análisis de RNA-Seq deberá tener ciertas consideraciones dependiendo del tipo de organismo estudiado. En esta revisión se exponen los principales factores a tener en cuenta para lograr un análisis de RNA-Seq consistente, replicable y concluyente, enfocándose específicamente en organismos procariotas.RNA-Seq is nowadays the method of choice for the sequencing of transcripts and transcriptomes in the field of molecular biology and gene expression assays. Until recently, this technique has allowed for the sequencing of RNA transcripts in an unprecedented scale and depth never reached in previous years; nevertheless, the reach and validity of the conclusions generated will depend strictly on an adequate experimental design and a robust analysis of the data. Given the inherent differences between prokaryotes and eukaryotes, the RNA-Seq analysis should take into account the type of organism studied. In this review we present the main factors to take into consideration when designing a consistent analysis for this type of data in prokaryotes, from the experimental design to the in silico analysis of the generated data.
  • Molecular Identification of Fungi Isolated from Bean Tissues with
           Anthracnose Symptoms

    • Abstract: En este estudio se realizó el aislamiento de hongos en tejidos foliares y vainas de fríjol con síntomas de antracnosis, procedentes de cultivos de diferentes municipios del departamento de Antioquia (Colombia). La identificación de los aislamientos se realizó con base en la secuenciación de las regiones ITS del ADN ribosomal y se confirmó por observación microscópica de estructuras reproductivas en aquellos aislamientos que esporulaban en medios de cultivo. En todas las muestras sintomáticas, se logró el aislamiento del agente causal de la antracnosis, .Colletotrichum lindemuthianum, siendo confirmada su identidad por PCR dúplex con cebadores específicos CD1/CD2 y CY1/CY2. En adición se obtuvieron 17 hongos endófitos, 14 de los cuales no esporularon en medio de cultivo (.Myceliasterilia), siendo identificados mediante análisis filogenéticos de regiones ITS como miembros de los Ascomycetes .Leptosphaerulina (tres aislamientos), .Diaporthe (tres aislamientos), .Gibberella (un aislamiento), .Plectosphaerella (un aislamiento) y .Biscogniauxia (un aislamiento); y de los géneros mitospóricos: Phoma (dos aislamientos), .Alternaria (dos aislamientos) y .Stemphylium (un aislamiento). Los tres hongos restantes se identificaron con base en caracteres morfológicos y secuenciación como miembros de los géneros Fusarium (dos aislamientos) y de la especie Curvularia lunata (un aislamiento). Este estudio aumenta el conocimiento de la micobiota de leguminosas, como base para el desarrollo de estudios futuros que permitan evaluar el efecto de estos hongos sobre el desarrollo de enfermedades como la antracnosis y de otros problemas bióticos y abióticos del cultivo del fríjol.In this work, endophytic fungi from leaves and pods of bean presenting anthracnose symptoms were isolated from plants collected at different municipalities in the province of Antioquia (Colombia). Isolates were identified by sequencing the rDNA ITS regions together with the examination of reproductive structures during sporulation in culture media.Colletotrichum lindemuthianum, the causal agent of anthracnose was isolated in all samples showing symptoms of this disease. These results were confirmed by duplex PCR using the specific primers CD1/CD2 and CY1/CY2. Additionally, 17 endophytic fungi were obtained. Fourteen isolates did not sporulate in culture media (.Myceliasterilia) but were identified by phylogenetic analysis of the ITS regions as the Ascomycetes: .Leptosphaerulina (3), .Diaporthe (3), .Gibberella (1), .Plectosphaerella (1) and .Biscogniauxia (1) and the mitosporic genera Phoma (2), .Alternaria (2) and .Stemphylium (1). Three isolates were identified combining morphological and molecular analysis as Fusarium (2) and Curvularia lunata (1). This work increases our knowledge of the mycobiota of legume plants and will serve as support of future studies aimed at determining the effect of these fungi on the development of anthracnose as well as other problems affecting the bean crop.

    • Abstract: To evaluate the seasonal variation and isotopic composition of phytoplankton, water samples were collected monthly between October 2007 and November 2008 in Lake Catalão, a floodplain lake at the confluence between rivers Negro and Amazon. Analyses of total chlorophyll concentration and ð13C and ð15N isotopic abundances were made from particulate size fractions of 30-60, 10-30 and < 10 µm in the littoral, pelagic, and floating meadows regions. Chlorophyll concentration was found to be inversely associated to lake depth, and high concentrations of chlorophyll in the floating meadows zone were significant. The fraction < 10 µm was the most abundant representing in average more than 40 % of the particulate matter. The ð13C values were relatively constant during the study (-25.1 % ∼ -34.0 %), whereas the ð15N values showed strong variability (15.6 % ∼ 2.4 %), which has been attributed to the resuspension of sediments during mixing of the water column. Mixing associated to the sudden drop in temperature during the rising water period was an important event in the trophic and isotopic dynamics of the lake. Variations in chlorophyll content were generally associated with the dilution process, in which concentration was inversely correlated to the water level, whereas abundance was directly correlated to the water level.Con el propósito de evaluar la variación estacional de la abundancia isotópica (ð13C e ð15N) del fitoplancton, muestreos mensuales fueron realizados entre octubre de 2007 y noviembre de 2008 en el lago Catalão, un lago de inundación en la zona de confluencia de los ríos Negro y Solimãµes, ubicado frente a la ciudad de Manaus (AM, Brasil). Análisis de la clorofila total y evaluaciones de la abundancia natural de ð13C y ð15N fueron realizados en las fracciones partículadas de 30-60, 10-30 y < 10 µm en las zonas litoral, pelágica y de macrófitas acuáticas. La concentración de clorofila presentó una relación inversa con la profundidad del lago, siendo relevantes las altas concentraciones encontradas dentro del tapete de macrófitas acuáticas. La fracción < 10µm fue la que presentó la mayor concentración de clorofila, representando más del 40% del material particulado. Los valores de ð13C fueron relativamente constantes durante el período de estudio (-25,1 % ∼ - 34 %), mientras que la abundancia natural de ð15N presentó una amplia variación (15,6 % ∼ – 2,4 %), que fue atribuida al proceso de resuspensión de los sedimentos en los procesos de mezcla de la columna de agua. En este contexto, el fenómeno de la mezcla asociada con la friaje durante el período de aguas altas, fue un evento importante en la dinámica trófica e isotópica del lago. En general las variaciones de la concentración de clorofila fueron asociadas al proceso de dilución, en el cual la concentración es inversa y la abundancia es directamente relacionada con el nivel del agua.
  • Nuevo registro de distribución de Cryptotermes brevis
           (Isoptera, Kalotermitidae) en Argentina

    • Abstract: The first record of the West Indian drywood termite Cryptotermes brevis (Walker, 1853) in the city of Corrientes (Argentina) is reported. Several C. brevis colonies were detected inside a local deposit, from wooden crates used for carrying fresh fruits. The observed damage consisted of small rounded holes, partially hollowed wood pieces and presence of debris. The importance of weather factors and the type of material of vegetable and fruit containers in the colonization and dispersion of C. brevis in this region of Argentina are discussed. Illustrations of soldiers and reproductive C. brevis, and an updated map of the distribution of this termite in Argentina are given.Se presenta el primer registro de Cryptotermes brevis (Walker, 1853) en la ciudad de Corrientes (Argentina). Se detectaron varias colonias de esta termita dentro de un edificio en contenedores de madera empleados para el transporte de fruta fresca. Los daños observados consistieron en orificios redondos, piezas de madera parcialmente excavadas y presencia de debris fecales. Se discute la importancia de factores climatológicos y del tipo de material de contenedores de fruta, en la colonización y dispersión de C. brevis en esta región de Argentina. Se presentan ilustraciones de soldados y reproductores de C. brevis y un mapa actualizado de la distribución de esta termita en Argentina.
           Elagatis bipinnulata (QUOY & GAIMARD, 1825) (PISCES: CARANGIDAE),

    • Abstract: The rainbow runner (Elagatis bipinnulata) scores high in trophic level (4.24) but it is not a voracious fish (Q/B = 10.8). Its diet is dominated by the dwarf herring (Jenkinsia lamprotaenia), eats more in the dry season, than in the rainy season and significantly more in the afternoon that in the morning suggesting preference for daylight feeding.

    • Abstract: The presence of tetrahedrally divided tatrasporangia in Ceramium bisporum Ballantine is reported for the first time. The plant was found as epiphytic on calcareous Halimeda tuna in coral reef environment in Caribbean Colombia. The taxon represents a new record for the country.Se reporta por primera vez la presencia de tetrasporangios divididos tetrahedricamente para la especie Ceramium bisporum. El alga fue encontrada epífita del alga calcárea Halimeda tuna en arrecifes coralinos en el Caribe colombiano. El taxón representa un nuevo registro para el país.
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