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  • Antibacterial activity of the skin secretion of Phyllomedusa azurea
           (Anura: Hylidae) from the Central Brazil Cerrado

    • Abstract: Phyllomedusa azurea is a frog species well distributed geographically in South America, including Brazilian biomes as Pantanal and Cerrado. Compared with other anurans from the Phyllomedusinae family, there are few reports on the bioactive potential of skin-derived molecules from this species. In this perspective, the aim of the present study was to evaluate the in vitro antibacterial activity of skin secretion of P. azurea by detection of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) of the growth of bacterial indicator strains and to determine if occurs a changing in the bacterial cell envelope permeability. The MIC determination was carried out by the microdilution plate method. The absorbance was measured and analyzed statistically using the t-test to compare two groups (0.05 % of significance). The impact of the crude extract on cell envelope permeability of Staphylococcus aureus ATCC 25923 was conducted by the crystal violet assay, and the absorbance was measured spectrophotometry followed by the calculation of the crystal violet uptake percentage. The specific MIC for S. aureus ATCC 25923 and Escherichia coli ATCC 25922 was 31.25 µg/mL, while for Bacillus subtilis ATCC 6633 was 125 µg/mL and Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 was 250 µg/mL. The treatment with crescent concentrations of frog skin secretion increased the crystal violet uptake by S. aureus ATCC 25923 cells, suggesting an action on the cell plasma membrane. The results demonstrated that the skin secretion of P. azurea presents antibacterial activity and merit further investigations to characterize the bioactive molecules.Resumen P. azurea es una especie de rana bien distribuida geográficamente en América del Sur, que incluye biomas brasileños como Pantanal y Cerrado. En comparación con otros anuros de Phyllomedusinae, existen pocos informes sobre el potencial bioactivo de las moléculas derivadas de la piel de esta especie. En esta perspectiva, el objetivo del presente estudio fue evaluar la actividad antibacteriana in vitro de la secreción de la piel de P. azurea mediante la detección de la Concentración Inhibitoria Mínima (CIM) del crecimiento de cepas indicadoras bacterianas y determinar si ocurre un cambio en la permeabilidad de la envoltura celular bacteriana. La determinación de MIC se llevó a cabo mediante el método de la placa de microdilución. La absorbancia se midió y se analizó estadísticamente mediante la prueba t para comparar dos grupos (0.05 de significancia). El impacto del extracto crudo sobre la permeabilidad de la envoltura celular de Staphylococcus aureus ATCC 25923 se realizó mediante el ensayo de cristal violeta, y se midió la absorbancia mediante espectrofotometría seguida del cálculo del porcentaje de absorción de violeta cristal. La CIM específica para S. aureus ATCC 25923 y Escherichia coli ATCC 25922 fue 31.25 μg / ml, mientras que para Bacillus subtilis ATCC 6633 de 125 μg / ml y Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 de 250 μg / ml. El tratamiento con concentraciones crecientes de secreción de piel de rana aumentó la absorción de violeta cristal por las células de S. aureus ATCC 25923, sugiriendo una acción sobre la membrana plasmática de la célula. Los resultados demostraron que la secreción de la piel de P. azurea presenta actividad antibacteriana y amerita más investigaciones para caracterizar las moléculas bioactivas.
       
  • Pollution in Lago de Tota, Colombia: acute toxicity on Daphnia magna
           (Cladocera: Daphniidae) and Hydra attenuata (Hydroida: Hydridae)

    • Abstract: Resumen La cuenca del Lago de Tota ha sido modificada por diversas actividades humanas, como deforestación, piscicultura y el monocultivo de cebolla larga (Allium fistulosum) con un elevado uso de agroquímicos y gallinaza cruda, causando deterioro de las características ecológicas del sistema léntico de alta montaña más grande de Colombia. En este trabajo se implementaron pruebas de toxicidad para determinar posibles efectos deletéreos sobre H. attenuata y D. magna. Se aclimataron los organismos y validaron los ensayos de toxicidad en condiciones de laboratorio, posteriormente se realizó la evaluación de agua y sedimentos (elutriados) provenientes de afluentes de la cuenca del lago: Hato Laguna, El Tobal, Los Pozos y Agua Blanca, durante dos periodos hidroclimáticos contrastantes. Se evidenció una mayor sensibilidad con los ensayos en H. attenuata, ya que señalan que aguas y elutriados de Hato Laguna, El Tobal y Los Pozos generaron respuestas de subletalidad (Kruskal-Wallis; P < 0.05) y letalidad. Se registra presencia positiva de al menos cinco plaguicidas no cuantificados antes en la cuenca (clorotalonilo, aldrin, dieldrin, DDT y congéneres). Estos resultados indicarían una potencial influencia negativa de las actividades antropogénicas sobre organismos acuáticos nativos, con posibles consecuencias sobre la composición, estructura y función de las comunidades hidrobiológicas. Lago de Tota basin is currently being impacted by human activities like agriculture, deforestation, large-scale fish farming and monoculture of onion long (Allium fistulosum) with high use of agrochemicals and chicken manure that contaminate runoff to aquatic systems in the largest high mountain lake in Colombia. We implemented toxicity tests to evaluate possible deleterious effects of contaminants on H. attenuata and D. magna, model organisms commonly used in aquatic contamination assessment. Firstly, the organisms were acclimated and toxicity tests were validated in laboratory conditions. Later, water and sediments (elutriates) were evaluated from tributaries of Lago de Tota basin: Hato Laguna, El Tobal, Los Pozos, and Agua Blanca stream, during two contrasting hydroclimatic periods. In addition, pesticides in sediments were evaluated with chromatography, spectrometry and ultraviolet detection techniques. Acute toxicity tests showed that H. attenuata was more sensitive than D. magna, as it showed sublethal (Kruskal-Wallis; P < 0.05) and lethal responses to exposure to waters and elutriates from Hato Laguna, El Tobal, and Los Pozos. At least five pesticides not quantified before in the basin were detected in chemical analyses (chlorothalonil, aldrin, dieldrin, DDT y congeners). These results indicate that anthropogenic activities have a potentially negative influence in aquatic communities composition, structure, and function, it´s demand attention in future research.
       
  • Ecosystem dynamics and services of a paired Neotropical montane forest and
           pine plantation

    • Abstract: Montane forests are one of the most decimated of Neotropical biomes even though they provide a suite of valuable ecosystem services such as provision of water to lowland settlements and prevention of erosion and mudslides. In some instances, to restore these and other ecosystem services, degraded montane forests are replaced by exotic tree plantations, which cover sizeable areas in several countries. Despite their importance for assessment of ecological services and for intrinsic ecological value, comparative studies of paired native montane forest and conifer plantation are scarce along the Northern Andean Cordillera. Additionally, extrapolations are challenging because each pair of communities is highly site specific due to environmental setting, age and density of plantation, and reforestation species. Here, we assess and compare structure, biogeochemistry and ecosystem services provided by closely positioned native forest and pine plantation from a protected montane area in Venezuela. Soil nutrients and soil carbon content were 60 and 54 % respectively higher in the forest. As consequence of pine’ growth form and leaf biochemistry, aboveground biomass and litter mass, as well as nutrient content and carbon stocks, were higher in the plantation. This results in the plantation storing 30 % more MgC ha-1 than the nearby forest. Canopy structure and litter properties influence the hydrology of both ecosystems through differences in rain throughfall. Most of the ecosystem services itemized are superior in the native forest, with exception that the younger plantation sequesters more carbon. An additional service provided by plantations might be that of ecological corridors that connect fragmented native forests. Our study, a specific case of nutrient and carbon cycling dynamics in paired montane forests and pine plantations, provides another set of data for the design of policy and management of considerable areas in the Neotropics with established conservation plantations.Resumen Los bosques montanos son uno de los biomas más devastados del Neotrópico aunque proporcionan valiosos servicios ecológicos al suministrar agua a los asentamientos humanos y proteger contra la erosión y los deslaves. En algunas instancias, para mantener esos servicios ecológicos, los bosques destruidos son reemplazados por plantaciones forestales en áreas considerables de varios países. Aunque existen unos pocos estudios comparativos en a lo largo del norte de la Cordillera Andina, las extrapolaciones son difíciles debido a que estos son altamente específicos debido al entorno ambiental, edad de las plantaciones, y a la especie de conífera dominante. Nosotros analizamos y comparamos la diversidad y estructura de la vegetación, la biogeoquímica y los servicios ecológicos proporcionados por un bosque montano y una plantación de pino adyacente en un área protegida de Venezuela. Los suelos del bosque nativo contienen 60 % más de nitrógeno y 54 % más de carbono que los de la plantación. Como consecuencia de la forma de vida de los pinos y de su composición foliar, la biomasa aérea y el contenido de nutrientes en la hojarasca seca son mayores en la plantación dando como resultado que la plantación contiene 30 % MgC ha-1 más que el bosque. La estructura del dosel influencia la hidrología de ambos ecosistemas mediante diferencias en la penetración del agua de lluvia. La mayoría de los servicios son de menor valor ecológico en la plantación de pino. Sin embargo, esta ofrece servicios que no existirían en su ausencia. En regiones montañosas, las plantaciones de coníferas fueron establecidas para mejorar la provisión de agua y estabilizar los suelos. Sin embargo, nuestros resultados sugieren que las plantaciones pueden proporcionar corredores ecológicos que conecten bosques nativos fragmentados. Nuestro estudio, al proveer un ejemplo adicional de dinámica ecológica comparada, expone las diferencias en servicios ecológicos proporcionados por un bosque montano y una plantación de pino y proporciona información para establecer políticas de conservación y manejo de recursos naturales en extensas áreas neotropicales.
       
  • Mitigation - adaptation synergies of climate change of coffee (Coffea
           arabica) production systems in Tolima, Colombia

    • Abstract: Resumen El cambio climático del planeta es generado principalmente por el incremento de las emisiones de gases de efecto invernadero. El Panel Intergubernamental de Cambio Climático (IPCC) ha establecido la mitigación y adaptación como estrategias para enfrentar el cambio climático; sin embargo, ambas estrategias se han evaluado poco en conjunto. Con el objetivo de estudiar las posibles sinergias entre mitigación y adaptación, se evaluaron tres sistemas de producción de café en el municipio de Líbano: sistemas agroforestales (SAF) con Cordia allidora, SAF con plátano y monocultivos con cuatro repeticiones por tratamiento. Como indicador de mitigación se estimó la huella de carbono en la producción y procesamiento del grano; mientras que la adaptación se midió como la diversidad de hormigas presentes. Los SAF con C. allidora favorecen tanto la mitigación como la adaptación al cambio climático, tienen una huella de carbono positiva además, tienen una mayor riqueza de géneros de hormigas (12.81 vs -3.0 vs -6.4 Mg CO2e/ha/año en huella de carbono y 1.3 vs 0.6 vs 0.6 de Índice de Margalef de hormigas en SAF con C. alliodora, SAF con plátano y monocultivo, respectivamente). Los sistemas de producción agrícola, manejados de forma amigable con el medio ambiente y en asocio con árboles nativos, son una buena estrategia para implementar programas de mitigación y adaptación al cambio climático. Incluir árboles nativos favorece económicamente a los productores, e incrementa los lugares de refugio y las condiciones mínimas de sobrevivencia, semejantes a los ecosistemas naturales para que los diferentes grupos de animales logren adaptarse a los cambios. Climate change is mainly generated by an increase of greehouse gas emissions. The Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC) has established mitigation and adaptation as strategies to deal with climate change. However, few studies have been developed jointly. With the purpose of studying the possible synergies between mitigation and adaptation, three coffee production systems in the municipality of Líbano: agroforestry systems (AFS) with Cordia allidora, AFS with plantain and monocultures, with four replications by treatment, were evaluated. As mitigation indicator, the carbon footprint in the coffee production and processing was estimated, whereas the adaptation was measured as the ant diversity. The AFS with C. alliodora favor both mitigation and adaptation to climate change since they have a positive carbon footprint and the greatest richness of ant genus (12.8 vs -3.0 vs -6.4 Mg CO2e/ha/year in carbon footprint and 1.3 vs 0.6 vs 0.6 of Margalef Index of ants in AFS with C. alliodora, AFS with plantain and monoculture, respectively). The agricultural production systems, environmental-friendly managed and associated with native trees, are a good strategy to implement in programs of mitigation-adaptation of climate change. The inclusion of native tree favors the producer’s economy and increases the shelter places and the minimal conditions for surviving, similar to natural ecosystems so the different groups of animals for climate change adaptation.
       
  • Do roadkill aggregations of wild and domestic mammals overlap'

    • Abstract: Domestic animals are involved in a large number of traffic accidents and they represent danger to humans due to their size. Despite this, few studies consider domestic animals. That is why we evaluate mammals’ roadkill aggregations in order to locate them and to determine if wild and domestic mammals’ roadkills overlap. In addition, we investigate the influence of the landscape on the location of the aggregations. This study was carried out on the BR-050 highway, an area of Cerrado biome, in Southeastern Brazil. The monitoring was executed from April 2012 to March 2013, by car, at an average speed of 60 km/h, with two observers looking for roadkills on the highway. We found 482 mammals’ roadkills, including 260 (54 %) wild mammals, 164 (34 %) domestic and 58 (12.0 %) undetermined specimens. Of the 21 recorded mammal species, five were domestic. The wild mammals’ roadkill rate was 0.03 (± 0.02) individuals/km/day and the domestic roadkill rate was 0.02 (± 0.01). We detected roadkill aggregations for wild and domestic mammals. Roadkill hotspots of domestic mammals and wild mammals did not overlap. The variables that had the highest influence on wild mammals’ roadkill probability were: agriculture and silviculture cover as positive effects and distance to the nearest river, to the urban perimeter and to a natural fragment as negative effects. For domestic mammals these variables were: area of the smallest fragment and distance to a natural fragment as positive effects and silviculture cover as a negative effect. The explanation for the wild and domestic mammals’ roadkill hotspot non overlapping seems to be the effect of each variable in determining the roadkill hotspot since their effect is different for wild and domestic mammals. On the other hand, this non overlapping can be a result of domestic mammals’ scavenging habits. We propose different kinds of mitigation measures in order to reduce domestic and wild mammals’ roadkill.Resumen Los animales domésticos están involucrados en una gran cantidad de accidentes de tránsito y representan un peligro para los humanos debido a su tamaño. A pesar de esto, pocos estudios consideran a los animales domésticos. Es por eso que evaluamos agregaciones de atropellos de mamíferos, con el fin de ubicarlas y determinar si los atropellos de los mamíferos silvestres y domésticos se traslapan. Además, investigamos la influencia del paisaje en la ubicación de las agregaciones. Este estudio se realizó en la carretera BR-050, un área del bioma Cerrado, en el sureste de Brasil. El muestreo se ejecutó entre abril 2012 y marzo 2013, en automóvil, a una velocidad promedio de 60 km/h, y dos observadores buscaron animales atropellados en la carretera. Encontramos 482 mamíferos atropellados, incluidos 260 (54 %) mamíferos silvestres, 164 (34 %) ejemplares domésticos y 58 (12 %) especímenes indeterminados. De las 21 especies de mamíferos registradas, cinco fueron de origen doméstico. La tasa de mortalidad de mamíferos silvestres fue de 0.033 (± 0.018) individuos/km/día y la de domésticos de 0.020 (± 0.008). Detectamos agregaciones de atropellos para mamíferos silvestres y domésticos. Los “hotspots” de atropellos de mamíferos domésticos y silvestres no se traslapan. Las variables que tuvieron la mayor influencia positiva en la probabilidad de atropello de mamíferos silvestres fueron: cobertura de la agricultura y la silvicultura; mientras que distancia al río más cercano, al perímetro urbano y al fragmento natural tuvieron un efecto negativo. Para los mamíferos domésticos estas variables con un efecto positivo fueron: área del fragmento más pequeño y distancia al fragmento natural; en tanto que la cobertura de silvicultura tuvo un efecto negativo. El que no haya un traslape de los atropellos de mamíferos silvestres y domésticos se podría explicar por el efecto de cada variable en la determinación de los “hotspots” de atropellos, ya que su efecto es diferente para los mamíferos silvestres y domésticos. Por otro lado, el no traslape puede ser el resultado de los hábitos carroñeros de los mamíferos domésticos. Proponemos diferentes tipos de medidas de mitigación con el fin de reducir los atropellos de los mamíferos domésticos y salvajes.
       
  • Proximate composition of several macroalgae from the coast of Salinas Bay,
           Ecuador

    • Abstract: Seaweeds are accessible and important marine organisms found in coastal zones, which have shown their nutritive potential as food or additive. These organisms are relatively abundant in the coastline of Ecuador, but their biochemical composition has not been adequately studied. Therefore, the aim of this research was to evaluate the proximate composition of seven seaweeds (four red, two brown, and one green) collected from Salinas Bay, Ecuador, as a contribution to the knowledge of the nutritional potential of these organisms that belong to this region. Moisture, ash, fat, fiber and protein contents were determined by standard protocols, while carbohydrates were obtained by difference. Energetic content (or caloric profile) was calculated according to the contributions of macromolecules (fats, proteins and carbohydrates). The parameters in highest proportion found in all species were carbohydrates (32.2-45.5 %) and minerals (or ash, 25.8-36.7 %), which play a significant role in human nutrition and the food industry. Furthermore, protein, fiber, and fat contents were relatively low, with values around 4.7-8.0 %, 0.9-5.0 %, and 0.3-3.0 %, respectively, indicating these organisms are a good option as healthy food. According to statistical analysis (ANOVA), each nutritive parameter was significantly different among the species (P < 0.05). Results indicate edible seaweeds from Ecuador have potential as nutritious food that could offer between 1 500-2 000 kcal kg-1, which is higher than many common vegetables.Resumen Las macroalgas marinas son organismos accesibles e importantes de las zonas costeras, los cuales han mostrado su potencial como alimentos o aditivos nutritivos. En la línea costera de Ecuador estos organismos son relativamente abundantes, pero su composición bioquímica no ha sido estudiada adecuadamente. En consecuencia, el objetivo de esta investigación fue evaluar la composición proximal de siete especies de macroalgas (cuatro rojas, dos pardas y una verde) que fueron recolectadas en la Bahía de Salinas, Ecuador, como una contribución al conocimiento del potencial nutricional de estos organismos pertenecientes a esta región. Los contenidos de humedad, cenizas, grasa, fibra y proteínas fueron determinadas mediante protocolos estándares, mientras que el contenido de carbohidrato fue obtenido por diferencia. El contenido energético (o perfil calórico) de las macroalgas fue calculado de acuerdo con las contribuciones de las macromoléculas (grasas, proteínas y carbohidratos). Los parámetros encontrados en mayor proporción en todas las especies fueron: carbohidratos (32.2-45.5 %) y minerales (o cenizas, 25.8-36.7 %), los cuales tienen importancia en la nutrición humana y la industria alimentaria. Además, los contenidos de proteína, fibra y grasa fueron relativamente bajos, encontrando valores alrededor de 4.7-8.0, 0.9-5.0, y 0.3-3.0 %, respectivamente, indicando que estos organismos son una buena y saludable opción como alimento. De acuerdo con el análisis estadístico (ANOVA), cada parámetro nutritivo fue significativamente diferente entre especies (P < 0.05). Los resultados indican que las algas comestibles de Ecuador tienen potencial como alimento nutritivo que pueden ofrecer entre 1 500-2 000 kcal kg-1, un aporte energético un poco mayor que muchos vegetales comunes.
       
  • Activity of a bat assemblage in northern Brazil (Mammalia: Chiroptera)

    • Abstract: Resumen La Amazonía es uno de los ecosistemas tropicales más biodiversos del mundo, característica atribuida a la complejidad estructural que le brinda la geología y la gran riqueza de sus suelos. Los murciélagos constituyen uno de los taxones de la clase Mammalia mejor representados en esta región, aun así, existen claros vacíos de conocimiento, principalmente, respecto a su ecología, con lo cual, en el presente estudio se pretende evaluar la influencia que tienen factores ambientales, como la temporada climática, temperatura (máxima y mínima), humedad relativa y porcentaje de fase iluminada de la Luna, en los patrones de actividad (riqueza, abundancia y gremios tróficos) de un ensamblaje de murciélagos en la Amazonía central brasilera. El estudio fue llevado a cabo en dos municipios del estado de Rondônia, empleando ocho redes de niebla, durante 62 noches de muestreo, abarcando las temporadas lluviosa y seca. En total fueron capturados 2 499 individuos de 58 especies, la familia mejor representada fueron los Phyllostomidae, mientras que la especie que registró la mayor frecuencia de capturas fue Carollia perspicillata (N = 859), seguida de C. brevicauda (N = 209). No se presentaron diferencias entre la estructura del ensamblaje considerando la temporada climática (lluviosa-seca), sin embargo, durante la temporada seca se registró un mayor número de especies e individuos (57 especies, N = 1 597), que en la temporada lluviosa (44 especies, N = 902). La abundancia de murciélagos estuvo influenciada principalmente, por la humedad relativa (P = 0.00) y la temperatura (mínima) (P = 0.04), mientras que, las especies respondieron diferencialmente al porcentaje de fase iluminada de la luna. En estos resultados se evidencia la influencia de factores ambientales en los patrones de actividad del ensamblaje de murciélagos en la Amazonía, en donde la ecología de las especies determina el tipo de influencia. Sin embargo, se requieren de estudios llevados a cabo por períodos más prolongados, para determinar si estos patrones se mantienen a lo largo del tiempo. The Amazon is considered one of the most biodiverse tropical ecosystems in the world thanks to the structural complexity that geology offers and the great biological richness of its soils. Further, concerning the Mammalian class, bats are one of the best represented taxa in the region, nevertheless their ecology is poorly studied. This study, evaluates the influence of environmental factors such as the climate season, temperature (maximum and minimum), relative humidity and lunar phase on the activity patterns (abundance and trophic guilds) of an assemblage of bats in the Brazilian central Amazon. This study was carry out in two municipalities of the state of Rondônia using eight mist nets during 62 nights of sampling, covering humid and dry periods. A total of 2 499 individuals of 58 species were captured. The best represented family was the Phyllostomidae, while the species that recorded the highest frequency of captures was Carollia perspicillata (N = 859), followed by C. brevicauda(N = 209). There were no significant differences between the structure of the assemblage considering the climatic season (rain-dry). However, during the dry season a greater number of species and individuals was recorded (57 species, N = 1 597) than in the rainy season (44 species, N = 902). The abundance of bats was influenced mainly by relative humidity (P = 0.00) and minimal temperature (P = 0.04), while the species responded differentially to the lunar phase. These results show the influence of environmental factors on the activity patterns of a bat assemblage in the Amazon, where the factors that influence them depends on the ecology of each species. However, studies carried out for longer periods are required to determine if these patterns are maintained over time.
       
  • Microbialite-like structures in Cladophora sp. (Ulvophyceae) mats from a
           subtropical Andean basin: ecological implications

    • Abstract: The solubility equilibrium of calcite is influenced by physicochemical, climatic and biological factors. Annual cycles of exceptionally prolonged drought, in conjunction with naturally occurring diffuse organic pollution, generate the unique conditions for the precipitation of lithified carbonate structures (microbialites). The aim of this article is to analyze the possible implications of calcite precipitation produced in mats of Cladophora sp. in an Andean subtropical basin, considering it is the first time this phenomenon is described for the region. We collected samples from selected sites at the Lules River Basin, in four sampling dates between the years 2003 and 2004, within a monitoring work of 15 years. Samples were analyzed using an electron microscope and X-ray diffraction analysis. We found that Gomphonema sp. attached to Cladophora sp. contributes to precipitation of calcite and formation of microbialite like structures, in the studied area. This work presents an initial discussion of the discovery of microbialites-like structures attached to Cladophora sp. mats in a subtropical Andean stream and the environmental conditions that lead to their production, as well as the possible ecological implications of these microbialites.Resumen La fase sólida de las sales de los cuerpos de agua juega un papel importante en la concentración de los elementos mayoritarios. El equilibrio de solubilidad de la calcita está influenciado por factores fisicoquímicos, climáticos y biológicos. Los ciclos anuales de sequía excepcionalmente prolongada, junto con la contaminación orgánica difusa de origen natural, generan condiciones únicas para la precipitación de estructuras de carbonato litificado (microbialitos). El objetivo de este artículo es analizar las posibles implicaciones de la precipitación de calcita producida en Cladophora sp. en una cuenca subtropical andina, considerando que es la primera vez que se describe este fenómeno para la región. Recolectamos muestras en sitios seleccionados en la Cuenca del Río Lules, en cuatro fechas de muestreo entre 2003 y 2004, en el marco de un trabajo de monitoreo de quince años. Usamos red Surber para realizar los muestreos. Las muestras de algas, una vez libres de macroinvertebrados, se secaron y pesaron. Analizamos utilizando microscopía electrónica y difracción de rayos X. Encontramos que Gomphonema sp. unido a Cladophora contribuye a la precipitación de calcita y la formación de estructuras similares a microbialitos, en el área estudiada. Este trabajo presenta una discusión inicial sobre el descubrimiento de estructuras similares a microbialitos unidas a filamentos de Cladophora sp. en una cuenca andina subtropical y las condiciones ambientales que conducen a su producción, así como las posibles implicaciones ecológicas de lo mencionado anteriormente.
       
  • Response of Fragaria Mexicana and rhizophere microbial
           communitites to temperature increase

    • Abstract: Resumen Para los próximos 100 años se pronostica un incremento en la temperatura del planeta de casi 4 °C, lo cual pondrá en riesgo las especies que no logren adaptarse. En esta investigación se determinaron las respuestas morfofisiológicas de F. mexicana y los cambios en la población de bacterias fijadoras de nitrógeno atmosférico (BFN) asociadas a sus raíces, debido a dos condiciones ambientales con diferencias medias de temperatura de 5.1 oC: invernadero (temperatura alta, TA) y campo abierto (temperatura baja, TB); y con cuatro tratamientos: sin inocular (T), inoculadas con la cepa ocho (CP8), cepa cuatro (CP4) y con ambas cepas (CP8 + 4). Las BFN fueron aisladas de la rizosfera de F. mexicana y transformadas genéticamente con reporteros, para cuantificar la población al final del experimento. Se midió el peso seco de la parte aérea y la raíz, la tasa de asimilación de CO2 (A), el inicio de la floración, el número de flores y frutos; y la persistencia de las bacterias fijadoras de N atmosférico (BFN). Además, se evaluó la concentración de NO3, NH4, P y materia orgánica (MO) en el sustrato, al inicio y final del experimento. Las plantas sometidas a alta temperatura presentaron mayor peso seco de la parte aérea y fotosíntesis; con una disminución en el peso seco de la raíz, y en el número de flores y frutos. La MO en el sustrato disminuyó, mientras que la disponibilidad de NO3, NH4 y P aumentó. El incremento de temperatura y la mayor presencia de N en el substrato provocaron reducción en la población de BFN. Estos resultados sugieren que temperaturas altas estimulan el crecimiento de F. mexicana y tienen un impacto negativo sobre su reproducción y en las BFN asociadas a sus raíces. The earth could experience a warming of 4 °C in the next one hundred years. This would put at risk the plants that can´t adapt. Fragaria mexicana is an endemic plant of temperate forest of Mexico. The response of this wild strawberry to temperature increasing has not been studied and could play an important role for event of global warming. This study determinate the morphological and physiological responses of F. mexicana and changes in the N2-fixing bacteria (BFN) population on its roots, due to two environmental conditions with differences of temperature 5.1 °C: greenhouse (high temperature, TA) and open land (low temperature, TB); and with four free-living nitrogen-fixing bacteria (BFN) treatments: non-inoculated (T), inoculated with strain eight (CP8), strain four (CP4), and strains eight and four mixed (CP8 + 4). BFN were isolated from the rhizosphere of F. mexicana and were genetically transformed with reporters to quantify the population at the end of the experiment. NO3, NH4 and P and organic matter (MO) in the substrate were determined at beginning and finish of the experiment. Shoot and root dry weight, photosynthetic rate, flowering and fructification starting, flowers and fruits number, were measured. Shoot dry weight and photosynthetic rate were lower in TB than TA, decreasing 3.1 g and 0.94 µmol m-2 s-1, respectively. Root dry weight was 3.0 g less in TA compared with TB. Number flowers decrease in 40.89 % and number fruits in 38.11 % on TA than TB. F. mexicana plants start flowering 14 days previously in TB than TA. MO in the substrate decrease in TA, while the concentration of NO3, NH4 and P, increased. Population of BFN was lower in TA. Results obtained indicated that higher temperature promotes the growth of F. mexicana and reduce its reproduction and BNF population associated with its roots.
       
  • The diversity of Odonata adults’s at Pampa Biome from Brazil

    • Abstract: The growth of humankind has brought with it several environmental problems that have worsened over time, including the loss of insect biodiversity. The Odonata order have been indicated by several authors as relevant bioindicators for assessing and monitoring environmental conditions of specific locations. The main objective of this study was to conduct an inventory of the Odonata diversity in the Pampa Biome, of the Southern region of the state of Rio Grande do Sul, Brazil. The species survey was conducted between November 2014 and October 2015. Adult insects were collected in Capão do Leão, Pelotas and Rio Grande cities. Each location was visited nine times, totalizing 54 samplings. Entomological nets were used for capturing adult insects, which were then kept in entomological envelopes. The identification of the specimens was carried out with taxonomic keys of Lencioni and Heckman. In addition, Chao-1, the Shannon-Wiener and Jackknife indexes were associated with the sampling areas. During the species survey a total of 2 680 Odonata specimens were collected, representing 45 species encompassed in 22 genera and six families. The Libellulidae and Coenagrionidae families were registered in 60 and 30 % of the specimens sampled, followed of the Aeshnidae, Calopterygidae, Gomphidae and Lestidae, of reduced occurrence. The genera Erythrodiplax, Micrathyria and Ischnura were found at least once in all the visited sites. The study resulted in the registration for the first time of the following species: Progomphus complicatus Selys, Lestes minutus Selys, Homeoura ambigua Ris, and Tauriphila xiphea Ris. These species were not previously reported in any Odonata study of the Brazilian state of Rio Grande do Sul. In regard to Odonata diversity in the Southern region of Rio Grande do Sul, Libellulidae and Coenagrionidae are the families more abundants. Erythrodiplax and Micrathyria are the most common genera. Miathyria marcella represented 9.6 % of all collected libellulidae and was the most abundant specie. Capão do Leão has the largest species diversity (wealth), the largest number of collected specimens and more diversity than Pelotas and Rio Grande. However, the results showed that the Odonatofauna in the State are still little known, and new studies are needed to better describe this group in other regions.Resumen El crecimiento de la humanidad ha traído consigo varios problemas ambientales que han empeorado con el tiempo, incluida la pérdida de biodiversidad de insectos. Varios autores han mencionado especies del orden Odonata como bioindicadores relevantes para evaluar y controlar las condiciones ambientales de lugares específicos. El objetivo principal de este estudio fue realizar un inventario de la diversidad de Odonata en el Bioma Pampa, en la región sur del estado de Rio Grande do Sul, Brasil. El censo de especies se realizó entre noviembre 2014 y octubre 2015. Se recolectaron insectos adultos en las ciudades de Capão do Leão, Pelotas y Rio Grande. Cada área fue visitada nueve veces, totalizando 54 muestreos. Se usaron redes entomológicas para capturar insectos adultos, que luego se mantuvieron en sobres entomológicos. La identificación de los ejemplares se realizó con claves taxonómicas de Lencioni y Heckman. Además, Chao-1, los índices de Shannon-Wiener y Jackknife se asociaron con las áreas de muestreo. Durante el censo de especies se recolectó un total de 2 680 especímenes de Odonata, que representan 45 especies comprendidas en 22 géneros y seis familias. Las familias Libellulidae y Coenagrionidae se registraron en 60 y 30 % de los especímenes muestreados, seguidos de los Aeshnidae, Calopterygidae, Gomphidae y Lestidae, de presencia reducida. Los géneros Erythrodiplax, Micrathyria e Ischnura se encontraron al menos una vez en todos los sitios visitados. El estudio resultó en el registro por primera vez de las siguientes especies: Progomphus complicatus Selys, Lestes minutus Selys, Homeoura ambigua Ris y Tauriphila xiphea Ris. Estas especies no se informaron previamente en ningún estudio de Odonata en el estado brasileño de Rio Grande do Sul. Con respecto a la diversidad de Odonata en la región sur de Rio Grande do Sul, Libellulidae y Coenagrionidae son las familias más abundantes. Erythrodiplax y Micrathyria son los géneros más comunes. Miathyria marcella representó el 9.6 % de todos los libellulidae recolectados y fue la especie más abundante. La ciudad de Capão do Leão tiene la mayor diversidad de especies (riqueza), la mayor cantidad de especímenes recolectados y la mayor diversidad que Pelotas y Río Grande. Sin embargo, los resultados mostraron que la Odonatofauna en el estado aún es poco conocida, y se necesitan nuevos estudios para describir mejor este grupo en otras regiones.
       
  • Geographical distribution of epiphytic angiosperms of the priority
           terrestrial region of Cerros Negro-Yucaño, Oaxaca, Mexico

    • Abstract: Resumen El conocimiento sobre la riqueza y la distribución de las plantas epifítas vasculares es aún incompleto en muchas áreas de México. Un ejemplo es la región terrestre prioritaria (RTP) Cerros Negro-Yucaño, que se ubica en el noroeste del estado de Oaxaca y pertenece a la región mixteca alta (Ñuu Savi Sukun, Ñuu vixi). Con base en la revisión de material de herbario en 12 colecciones institucionales mexicanas y en la recolección de especímenes en algunas localidades, principalmente cubiertas por bosque de encino, en 17 de los 18 municipios que incluye la RTP, se compilo un listado de las angiospermas epífitas. Se registró la presencia de 40 especies, distribuidas en 13 géneros y cinco familias; 28 taxa son endémicos de México y tres de ellos se conocen solamente de Oaxaca. Los géneros Tillandsia (18 spp.) y Peperomia (4) fueron los mejor representados en el área. El bosque de encino fue el tipo de vegetación en el cual se encontraron más epífitas (32 spp.) y también el intervalo altitudinal de 1 900 a 2 100 m (19 spp.). Plantas en floración de Artorima erubescens, Laelia albida, L. furfuracea y Prosthechea karwinskii, son utilizadas por pobladores de la región como ornamentales, durante las celebraciones religiosas de Día de Muertos y Semana Santa. Este impacto humano podría representar una amenaza para las poblaciones silvestres de estas especies en el futuro. The knowledge on richness and distribution of epiphytic vascular plants is still incomplete in many areas of Mexico. An example is the terrestrial priority region (RTP) Cerros Negro-Yucaño, which is located in the Northwest portion of Oaxaca and belongs to the Mixteca Alta Region (Ñuu Savi Sukun, Ñuu Vixi). Based on herbarium material revision of 12 Mexican institutional collections and the collection of specimens in some localities, mainly covered by oak forest, in 17 of the 18 municipalities included in the RTP, we compiled a list of epiphytic angiosperms. The presence of 40 species, distributed in 13 genera and five families was recorded; 28 taxa are endemic to Mexico and three of them are only known from Oaxaca. The genera Tillandsia (18 spp.) and Peperomia (4) were the best represented genera in the area. Oak forest was the type of vegetation in which the most of the epiphytes were found (32 spp.), and also the altitudinal range between 1 900 and 2 100 m (19 spp.). Flowering plants of Artorima erubescens, Laelia albida, L. furfuracea, and Prosthechea karwinskii are used by the local people as ornamentals during the religious celebrations of Day of the Dead (Mexico) and Holly Week. This human impact might be a threat to the wild populations of these species in the future.
       
  • Micro-environmental features associated to container-dwelling mosquitoes
           (Diptera: Culicidae) in an urban cemetery of the Dominican Republic

    • Abstract: Mosquitoes (Diptera: Culicidae) are important vectors of diverse pathogenic organisms, particularly arboviruses and protozoa. The immature stages of mosquitoes occur in a wide range of natural or human-made aquatic habitats. On this basis, some anthropogenic places such as cemeteries, usually serve as thrive and productive artificial-breeding habitats for mosquitoes. Despite being important foci for vector species, urban cemeteries are frequently overlooked in control and surveillance programs. This study evaluates the association of ecological variables and attributes (type of material, presence of flowers, water availability and height from the ground) of the breeding sites with the levels of infestation of mosquito immature stages. In 2017, an entire urban cemetery in Jarabacoa (Dominican Republic) was sampled at two different climatic periods (March: dry and August: rainy) for the characterization of the artificial breeding-sites, collection of immature stages of culicids and subsequent laboratory rearing for species identification. In total 968 containers were studied, containing 7 758 immature stages in 203 (21.0 %) water-filled containers which accounted for four species: Culex quinquefasciatus (50.5 %), Aedes aegypti (47.1 %), Aedes albopictus (1.9 %) and Culex nigripalpus (0.4 %). The mean of A. aegypti immatures in infested containers was roughly two times higher compared to C. quinquefasciatus and significantly lower compared to A. albopictus. The total Container Index (CI) was 20.9 %, and among the type of materials, those made from rock (cement, ceramic, and mud) and plastic had the highest CI = 25.9 % and 23.4 %, respectively. Almost 95 % of the total infested water-filled containers were made of plastic or rock. No association was found between the type of material of the containers and the density of mosquitoes. However, overall, greater densities of immature stages were found at ground than at higher levels. A weak positive correlation between water volume and density was found in some species of immature stages. Significantly higher number of C. quinquefasciatus were recorded in containers with flowers and large water volume. In contrast, A. aegypti immature stages were more frequent in containers without flowers. A weak negative association between water volume and infestations was found for A. albopictus immatures. As reflected of their opportunistic behaviour and broad ecological plasticity, Culex spp. and Aedes spp. mosquitoes were abundant pests in cemetery habitats where were able to breed in almost any kind of water-filled container regardless the type of material. However, our study showed that some ecological variables have critical impact for the development of the immature stages of some species. The health authorities and cemetery keepers can benefit from these results by focusing on the implementation of detailed plans and integrated strategies for the control and prevention of cemetery infestations by mosquitoes.Resumen Los mosquitos (Diptera: Culicidae) son importantes vectores de diversos organismos patógenos, tales como arbovirus y protozoos. Los estadios inmaduros de los mosquitos pueden encontrarse en un amplio abanico de hábitats, tanto de origen natural como humano. Algunos lugares antrópicos, como los cementerios, sirven como prósperos hábitats artificiales para el desarrollo del ciclo de vida de los mosquitos. A pesar de constituir importantes focos para especies de interés vectorial, los cementerios urbanos son frecuentemente olvidados en los programas de vigilancia y control. Este estudio evaluó la asociación de algunas variables ecológicas (tipo de material, presencia de flores, disponibilidad de agua, y altura respecto al suelo) de los lugares de cría (recipientes) con los niveles de infestación de las fases preimarginales de los culícidos. En 2017, un cementerio urbano en Jarabacoa (República Dominicana) fue inspeccionado durante dos periodos climáticos (es decir: marzo: estación seca y agosto: estación húmeda) para: caracterizar los lugares de cría artificiales, captura de los estadios inmaduros de culícidos e identificación de los adultos emergidos a partir de las fases inmaduras. En total, 968 recipientes fueron examinados, conteniendo 7 758 inmaduros en 203 (21.0 %) recipientes con agua pertenecientes a cuatro especies, Culex quinquefasciatus (50.5 %), Aedes aegypti (47.1 %), Aedes albopictus (1.9 %) y Culex nigripalpus (0.4 %). El índice de recipiente (IR) fue del 20.9 %, y los recipientes fabricados a partir de roca (cemento, cerámica y barro) y plástico tuvieron el mayor IR = 25.9 y 23.4 %, respectivamente. Casi un 95 % de los recipientes con agua infectados estaban constituidos de materiales tipo plástico o roca. No se encontró asociación entre el tipo de material del recipiente y la densidad. En general, mayor densidad de estadios inmaduros fue observada a nivel del suelo que a alturas mayores. Se observó un incremento significativo del número de C. quinquefasciatus en recipientes con flores y grandes volúmenes de agua. Por el contrario, los estadios de A. aegypti fueron más frecuentes en recipientes sin flores. Como reflejo de su comportamiento oportunista y amplia plasticidad ecológica, los mosquitos Culex y Aedes fueron abundantes en los cementerios, siendo capaces de desarrollar su ciclo de vida acuático en cualquier tipo de recipiente, con independencia del material que lo constituya. Nuestro estudio, por tanto, mostró que algunas variables ecológicas tienen un impacto crítico sobre el desarrollo de los estadios inmaduros de algunas especies de mosquitos. Tanto las autoridades de salud pública como los cuidadores del cementerio pueden beneficiare de estos resultados centrándose en la implementación de planes detallados y estrategias inte...
       
  • Review: nutritional needs of South American Pimelodidae fish (Teleostei:
           Siluriformes)

    • Abstract: Resumen Los silúridos, también conocidos como bagres, es uno de los grupos más representativos de peces. Conformado por 31 familias, 412 géneros y 2 600 especies aproximadamente, por lo que se ubica, en extensión, como el tercero entre todos los órdenes de teleósteos de los cuales 13 familias (64 % de las especies) residen en sur América. Dentro de este orden se encuentra la familia Pimelodidae, Eigenmann y Eigenmann (1889), siendo la más abundante en siluriformes neotropicales distribuidos ampliamente en América del Sur y Central. Algunos representantes de la familia Pimelodidae son individuos cuyas características específicas los hacen aptos para ser manejados en cautividad con fines comerciales. Uno de los principales factores negativos para hacer rentable este ejercicio comercial es la falta de conocimiento relacionado, entre otras cosas, con los elementos básicos que permitan formular dietas alimenticias bien equilibradas y que aporten al individuo los requerimientos nutricionales básicos para un óptimo desarrollo. Es por lo anterior, que se requiere realizar una recopilación bibliográfica general de los principales aspectos relacionados con la alimentación y nutrición de esta familia. Nutritional requirements of Pimelodidae fishes in South America (Teleostei: Siluriformes). The Silurids, also known as catfish is one of the most representative groups of fish. Comprised of 31 families, 412 genera and approximately 2 600 species, which places them, as the third among all orders of teleost of which 13 families (64 % of the species) living in South America. Within this order is the Pimelodidae, Eigenmann and Eigenmann family (1889), the most abundant in Neotropical siluriformes widely distributed in South and Central America. Some representatives of the Pimelodidae family are individuals whose specific characteristics make capable of being handled in captivity for commercial purposes. One of the main negative factors for profitable business is the lack of knowledge about, among other things, the basic elements to formulate well-balanced diets and to provide the fish with their basic nutritional requirements for an optimal development. For this reason, it is of paramount importance to make a general bibliography review of the main aspects related to food and nutrition of the family.
       
  • Arboreal resprouting in the Calakmul, Campeche, Mexico tropical forest
           regeneration

    • Abstract: Resumen Los estudios detallados para comprender como los bosques neotropicales se reestablecen en el tiempo, a través de la sucesión secundaria aún resultan necesarios. Entre los mecanismos de regeneración que actúan en los bosques tropicales, el rebrote de árboles predomina en especies leñosas, con la ventaja de reiniciar el crecimiento de raíces establecidas, que permiten restituir el dosel forestal. El objetivo de este estudio fue identificar y cuantificar las especies arbóreas con capacidad de rebrote en distintas etapas de la sucesión secundaria (barbecho) después del sistema agrícola tradicional de milpa, comparadas con las comunidades del bosque tropical predominante en la Reserva de la Biósfera de Calakmul, y cómo influyen estas especies en la recuperación de la composición de este ecosistema. Se calculó el porcentaje de especies con y sin rebrote para cada etapa sucesional. Se registraron 13 972 individuos (32 % con rebrote y 68 % sin rebrote) y 168 especies (79 % con rebrote y 21 % sin rebrote), el porcentaje de individuos con rebrote va disminuyendo conforme avanza la edad de la sucesión. El número de individuos con rebrote y la composición de especies fueron significativamente diferentes entre etapas. Se puede concluir que la mayoría de especies arbóreas del bosque en Calakmul, presentan la capacidad de rebrotar, lo cual tiene influencia en el rápido proceso sucesional del bosque después de la roza-tumba y quema, restituyendo la cobertura y estructura forestal, así como la composición de las especies originales. Detailed studies to understand recovering of Neotropical forests over time, through secondary succession, are still necessaries. Between acting mechanisms of regeneration in the tropical forests, the arboreal resprout predominates in woody species, with the advantage of restart the growth from still rooting plants, allowing the restoring of forest canopy. The study aim was to identify and quantify the tree species with resprouting capacity in different stages of secondary succession (tree-fallow) after the traditional milpa agricultural system, compared with tropical forest communities in the Calakmul Biosphere Reserve and, enlightening how these species influences the recovery of the composition of this ecosystem. Was calculated the proportions of species with or without resprouting by successional stage. There were 13 972 individuals (32 % resprouting and 68 % not resprouting) and 168 species (79 % resprouting and 21 % not resprouting), the percentage of individuals regrowing decreases as the successional stage progresses. The number of individuals resprouting and species composition were significantly different between successional stages. In conclusion, mostly arboreal species in the region of Calakmul, can regrow, which influences the successional development of the forest after slash-and-burn, helping to restore the coverage, structure, as well as species composition original.
       
  • Regeneration of trees in natural ecosystems and plantations of Pinus
           patula (Pinaceae), in an Andean altitudinal gradient (Azuay, Ecuador)

    • Abstract: Resumen Los bosques y páramos andinos poseen alta riqueza de especies, pero están amenazados constantemente por deforestación. La regeneración natural arbórea de estos ecosistemas condiciona su estructura y funcionalidad en el futuro, pero ha sido escasamente evaluada. En Los Andes del sur del Ecuador, también existen plantaciones forestales de Pinus patula (pino) abandonadas, que podrían ser escenarios para promover la regeneración natural. En un gradiente altitudinal andino, se evaluó florísticamente parámetros de la regeneración arbórea en dos escenarios de estudio: ecosistemas naturales (páramos herbáceos y bosques naturales) y plantaciones de pino. Para ello la diversidad de la regeneración fue descrita mediante la riqueza de especies, índice de Shannon y composición florística. La abundancia a través del número de individuos; estos parámetros fueron comparados en ambos escenarios. También se determinó qué variables ambientales o predictoras de: cobertura de dosel, edáficas, estructura arbórea, distancia horizontal y fisiográficas, explicaron con mayor magnitud la variación en los parámetros de la regeneración. Para ello se realizó un análisis de partición de la variación. La riqueza y diversidad de especies fueron mayores en los ecosistemas naturales, la composición florística fue diferente y su abundancia fue similar. En los ecosistemas naturales, el área basal y la densidad arbórea explicaron mayormente la variación en la riqueza, diversidad y abundancia. No así en las plantaciones de pino en donde la distancia horizontal hacia los bosques nativos fue la predictora que mayormente las explicó. La mayor diversidad de regeneración en los ecosistemas naturales (bosques) está asociada con la existencia de biotipos arbóreos, arbustivos y disponibilidad de semillas, adicionando a la eficiencia en los procesos de dispersión a nivel de micro-hábitat, aspectos que son limitantes en las plantaciones de pino, en los cuales la dispersión o disponibilidad de semillas depende de la cercanía a los ecosistemas naturales. Andean forests and paramo have high species richness, but constantly they are threatened by deforestation. Natural arboreal regeneration of these ecosystems will condition their structure and functionality in the future, but now it has been poorly evaluated. In the Andes of Southern Ecuador, there are also abandoned Pinus patula (pine) forest plantations, which could be scenarios to promote natural regeneration. In an Andean altitudinal gradient, we evaluated floristically parameters of tree regeneration between two study scenarios: natural ecosystems (herbaceous paramos and natural forests) and pine plantations. For this, the diversity of regeneration was described by species richness, Shannon index and floristic composition. Abundance with the number of individuals; these parameters were compared between two scenarios. We determined also that environmental variables or predictors of: canopy cover, soil, tree structure, horizontal distance and physiographic explained the variation in the parameters of regeneration with greater magnitude. For this, a partition analysis of the variation was carried out. Richness and diversity of species were greater in natural ecosystems, whereas floristic composition was different and its abundance was similar. In natural ecosystems, basal area and tree density explained mainly the variation in wealth, diversity and abundance. Not so in pine plantations where horizontal distance to the native forests was the predictor that mostly explained. The greatest diversity of regeneration in natural ecosystems (forests) is associated with the existence of arboreal, shrub and seed biotypes. It is adding to this, efficiency in dispersion processes at the micro-habitat level. These aspects are limiting in plantations of pine, in which the dispersion or availability of seeds depends on the proximity to natural ecosystems.
       
  • Diet of the leaf litter frog Craugastor rhodopis (Anura: Craugastoridae):
           an abundant species in the mountainous region of the east Mexico

    • Abstract: Resumen La composición de la dieta en anfibios puede ser influenciada por diversos factores que causan su variación intraespecífica, como pueden ser la distribución geográfica, ontogenia, estacionalidad, y el sexo de los organismos. El objetivo de este estudio fue analizar la composición de la dieta en adultos de la Craugastor rhodopis (rana hojarasquera común) en la región montañosa del centro de Veracruz, México. Un total de 77 individuos adultos fueron colectados durante la época de lluvias de 2012, de los cuales 66 tuvieron contenido estomacal. Se realizó un análisis de la variación intersexual en la diversidad de la dieta, y el volumen, número de presas, y número de categorías de presa consumidas. La dieta de C. rhodopis estuvo compuesta por 20 categorías, de las cuales predominó Orthoptera en cuanto a número, volumen, frecuencia de ocurrencia e importancia relativa. Los machos consumieron presas de menor tamaño en relación a las hembras. Aunque ambos sexos consumieron similar número de presas, se encontró un efecto significativo de la interacción del sexo y el tamaño de las ranas sobre esta variable de la dieta, en la cual las hembras pequeñas consumen más presas que las grandes, y los machos grandes consumen más presas que los pequeños. El alto consumo de ortópteros (al menos en cuanto a volumen) es un fenómeno común dentro de la familia Craugastoridae y posiblemente está relacionado con el éxito de algunas especies en los ecosistemas donde habitan. A pesar de que la composición de la dieta fue similar entre sexos en C. rhodopis, se sugiere que la competencia intersexual por los recursos tróficos es mínima, dadas las diferencias en el tamaño de presas consumidas por machos y hembras. Dietary composition in amphibians may be influenced by several factors that cause their intraspecific variation, such as geographic distribution, ontogeny, seasonality, and sex of organisms. The objective of this study was to analyze the composition of the diet in adults of the Polymorphic Robber Frog Craugastor rhodopis in the mountainous region of central Veracruz, Mexico. A total of 77 adult individuals were collected during the rainy season of 2012, of which 66 had stomach contents. We performed an analysis of the intersexual variation in diet diversity, volume, number of prey, and number of prey categories consumed. The diet of C. rhodopis was composed by 20 categories. Orthoptera predominated in terms of number, volume, frequency of occurrence, and relative importance. Males consumed smaller prey items relative to females. Although both sexes consumed similar numbers of prey, we found a significant effect of interaction of sex and size of frogs on this variable, with small females consuming more prey than the large ones, whereas in males the opposite occurred. High consumption of orthopterans (at least in volume) is a common phenomenon within Craugastoridae and is possibly related to the success of some species in the ecosystems where they live. Although the composition of the diet was similar between sexes in C. rhodopis, we suggest that intersexual competition for trophic resources is minimal, given differences in prey size consumed by males and females.
       
  • Relative humidity, temperature, substrate type, and height of terrestrial
           lichens in a tropical paramo

    • Abstract: Lichens are traditionally divided into types such as “crustose”, “foliose” and “fruticose”, with different shapes and heights. Substrate, temperature and water are thought to affect lichen height, but there are few studies regarding tropical paramo lichens. Along 2015 I measured those variables in the terricolous lichens of the Cerro Buena Vista, paramo (Costa Rica, 9°33’ N & 83°45’ W). The measurements were taken inside the lichens and in the substrate under them, in 61 randomly located quadrats (50 x 50 cm). Lichens grew taller on (1) warmer ground, (2) wetter ground, (3) the moister Caribbean slope, and (4) the season with heavier rainfall, as expected. Apparently, atmospheric factors are more important than substrate in the determination of temperature, relative humidity and growth of lichens. Physiologically available water seems to be the main determinant of lichen vertical growth in the Buena Vista paramo.Resumen Los líquenes se dividen tradicionalmente en morfotipos como “crustoso”, “folioso” y “fruticoso”, con diferentes formas y alturas. Se cree que el sustrato, la temperatura y el agua afectan la altura de los líquenes, pero existen pocos estudios con respecto a los líquenes tropicales. A lo largo del 2015, medí esas variables en los líquenes del suelo en el páramo de Cerro Buena Vista (Costa Rica, 9 ° 33’N; 83 ° 45’W). Las medidas se tomaron dentro de los líquenes y en el sustrato debajo de ellos, en 61 cuadrantes ubicados al azar (50 x 50 cm). Los líquenes fueron más altos en (1) suelo más cálido, (2) suelo más húmedo, (3) la pendiente del Caribe, que es más húmeda y (4) la temporada con lluvias más intensas, como se esperaba. Aparentemente, los factores atmosféricos son más importantes que el sustrato en la determinación de la temperatura, la humedad relativa y el crecimiento de los líquenes. El agua fisiológicamente disponible parece ser el principal determinante del crecimiento vertical de los líquenes en el páramo del Cerro Buena Vista.
       
  • Lipid profile and assays of the antioxidant, insecticide and antifeedant
           activities of the marine sponge Iotrochota birotulata (Iotrochotidae:
           Demospongiae)

    • Abstract: Resumen Los mares ocupan aproximadamente tres cuartas partes de la tierra constituyendo el hábitat de una gran cantidad de especies de flora y fauna. Como parte de los organismos marinos, los phylum bioquímicamente más estudiados son Porífera, Cnidaria y más recientemente Ascomycota, de todos ellos se han aislado e identificado un gran número de compuestos químicos, los cuales han mostrado diferentes tipos de actividades biológicas, principalmente citotóxica, bactericida y antioxidante, entre otras. En esta investigación se estudió la esponja marina Iotrochota birotulata recolectada en Punta Bello-Córdoba en el Caribe colombiano lográndose determinar su perfil lipídico a partir del análisis de los correspondientes espectros de masas de sus compuestos constituyentes, fueron identificados 19 ácidos grasos, los cuales son reportados por primera vez para esta especie. Además fueron identificados 10 esteroles. Se encontraron ácidos grasos con cadenas carbonadas entre C15 y C27, mostrando una amplia diversidad estructural lo cual es característico del phylum porífera. En cuanto a los esteroles se encontraron estructuras principalmente con núcleos Δ5 y Δ7 que son los más abundantes en las esponjas. Se encontró moderada actividad antioxidante en la estabilización del catión radical ABTS+• y baja actividad en la estabilización del radical DPPH•, el mayor valor de inhibición se encontró en el extracto acuoso con un valor de IC50 de 43.9 µg/ml frente al catión radical ABTS+•, mostrando que I. birotulata puede producir compuestos con moderada actividad antioxidante. En el ensayo de actividad insecticida, se encontró afectación larval en los extractos metanólico y acuoso en todas las concentraciones y en todos los tiempos de exposición evaluados frente a Spodoptera frugiperda, también se determinó que estos extractos inducen un efecto antialimentario en las larvas como parte del mecanismo insecticida. Se determinaron las condiciones y los tiempos de exposición óptimos para la mejor eficiencia del ensayo, las cuales fueron de 3 000 µg/ml y 48 h para el extracto metanólico y 2 000 µg/ml y 24 h para el extracto acuoso, respectivamente. En conclusión, los extractos evaluados de I. birotulata mostraron moderada actividad antioxidante y buenas e interesantes actividades insecticida y antialimentaria. It is estimated that three quarters of earth´s surface is occupied by the oceans. This constitutes the habitat of a large number of species of flora and fauna. As part of the marine organisms, the most studied biochemical phylum are Porifera, Cnidaria and more recently Ascomycota, from which a large number of chemical compounds have been isolated and identified. These have shown different types of biological activities, mainly cytotoxic, bactericidal and antioxidant. In this research the marine sponge Iotrochota birotulata collected in Punta Bello-Córdoba in the Colombian Caribbean was studied, and its lipid profile from the analysis of the corresponding mass spectra of its constituent compounds was determined, 19 fatty acids were identified, which are reported for the first time for this specie, besides 10 sterols were identified. Fatty acids with carbon chains between C15 and C27 were found, showing a wide structural diversity, which is characteristic of the porifera phylum. The sterols showed structures mainly with nucleus Δ5 and Δ7, which are the most abundant in sponges. Moderate antioxidant activity was found in the stabilization of the radical cation ABTS+• and low activity in the stabilization of the radical DPPH•, the highest inhibition value was found in the aqueous extract with an IC50 de 43.9 µg/ml against the radical cation ABTS+•, showing that I. birotulata can produce compounds with moderate antioxidant activity. In the insecticidal activity test, larval affectation was found in methanolic and aqueous extracts at all concentrations and at all times of exposure evaluated against Spodoptera frugiperda, it was also determined that these extracts induce an antifeedant effect on the larvae as part of the mechanism insecticide. The optimal conditions and exposure times were determined for the best efficiency of the assay, which were 3 000 µg/ml and 48 h for the methanolic extract and 2 000 µg/ml and 24 h for the aqueous extract, respectively. In conclusion, the evaluated extracts of the I. birotulata showed moderate antioxidant activity and good and interesting insecticidal and antifeedant activities.
       
  • Vertical stratification of weaver spiders (Araneae) in fragments of
           tropical dry forest from Colombian Caribbean

    • Abstract: Resumen Las arañas han logrado colonizar la mayoría de ambientes terrestres, siendo comunes en los bosques. Este grupo se ha reportado desde el suelo hasta el dosel y sus patrones de distribución vertical han demostrado ser variables en distintos ecosistemas. Teniendo en cuenta esta variabilidad, el objetivo de este trabajo fue analizar los cambios en composición y diversidad de arañas tejedoras en un plano vertical en dos fragmentos de bosque seco con diferente calidad estructural de la vegetación. Para ello fueron seleccionados dos sitios: Reserva Campesina La Montaña (RCM) y Corrales de San Luis (CSL). En cada uno, se realizaron cuatro muestreos, dos en la época seca y dos durante las lluvias. Por fragmento se seleccionaron cinco estaciones distanciadas 100 m y en cada una se marcaron tres puntos distanciados 30 m donde fueron muestreados los estratos vegetales: bajo (20 cm - 2 m), medio (5 - 8 m) y alto (≥ 10 m). Para capturar las arañas, se utilizó la técnica agitación de follaje. 521 individuos agrupados en nueve familias y 36 morfoespecies fueron capturados; siendo la RCM el fragmento con la mayor abundancia y riqueza (n = 335; 28 morfos). Por otro lado, el estrato bajo presentó la mayor diversidad del grupo, independientemente de la época y el fragmento. Se observó un patrón de estratificación vertical para la comunidad de arañas tejedoras durante las lluvias en la RCM, el cual se perdió en la seca, mientras que en CSL no fue posible observar este patrón en ninguna de las temporadas. Los resultados indican que las comunidades de arañas presentes en fragmentos de BST pueden estratificarse verticalmente, lo cual depende de la época del año y las condiciones de la vegetación en el área de estudio. Spiders have managed to colonize most terrestrial environments, being common in forests. This group has been reported from the ground to the canopy and their vertical distribution patterns have been shown to be variable in different ecosystems. Taking into account this variability, the aim of this work was analyzed the changes in composition and diversity of weaver spiders in a vertical plane in two fragments of dry forest with different structural quality of vegetation. For this purpose, two sites were selected: Reserva Campesina La Montaña (RCM) and Corrales de San Luis (CSL). In each one, four samplings were carried out, two in the dry season and two during the rains. Per fragment, five stations spaced 100 m apart were selected and three points were marked 30 m apart where the plant strata were sampled as: low (20 cm - 2 m), medium (5 m - 8 m) and high (≥ 10 m). To capture the spiders, the foliage beating technique was used. 521 individuals grouped into nine families and 36 morphospecies were captured; RCM being the fragment with the greatest abundance and wealth (n = 335, 28 morphs). On the other hand, the low stratum presented the greatest diversity of the group, regardless of the time and the fragment. A vertical stratification pattern was observed for the community of weaver spiders during the rains period in the RCM, which disappeared in the dry season, whereas in CSL was not possible to observe this pattern in any of the seasons. The results indicate that the spider communities present in BST fragments are able to be vertically stratified, which depends on the time of year and the vegetation conditions in the study area.
       
  • Spatial distribution of Euphausiids (Euphausiacea) off Malpelo Island,
           Colombian Tropical Pacific

    • Abstract: Euphausiids migrate vertically in the water column as part of their diel cycle. These migrations make them a key element in the biological pump of the pelagic environment. In order to evaluate the vertical distribution of euphausiids around Malpelo Island (3.8 - 4.2 N & 81.4 - 81.8 W), we took stratified zooplankton samples (0-50, 50-100, and 100-150 m) during the Pacífico-ERFEN campaign in September 2012. A total of 10 species belonging to four genera were identified. Euphausia diomedeae was the most abundant species in the 0-50 and 100-150 m layers, whereas E. distinguenda was the most abundant species in the 50-100 m layer. Based on quasi-Poisson generalized linear distribution models we found that abundance in the 50-100 m layer was significantly higher than in the 100-150 m layer (t= 3.05, p < 0.05). There were no significant differences associated with sampling hour (diurnal/nocturnal) (t= 0.07, p = 0.94). We calculated a vertical distribution index (VDI) based on abundance, showed that euphausiid species were concentrated in the 50-100 m layer during day and night. Calyptopis larvae dominated in abundance at all depth layers, followed by furcilia larvae, juveniles, and adults. The abundance of the latter increased gradually from the most superficial layer to the deepest layer, whereas juveniles showed the opposite pattern. This is the first study to describe the taxonomic composition, and vertical and spatial distribution of euphausiids associated with Malpelo Island, Colombian Pacific.Resumen Los eufáusidos son organismos que realizan migraciones verticales en la columna de agua como parte de un ciclo nictemeral, estas migraciones los convierten en un elemento clave del ambiente pelágico. Con el propósito de evaluar la distribución vertical de los eufáusidos alrededor de la isla Malpelo (3.8-4.2 N & 81.4-81.8 W), se tomaron muestras estratificadas (0-50, 50-100 y 100-150 m) de zooplancton durante la campaña Pacífico-ERFEN de septiembre 2012. Se identificaron un total de 10 especies pertenecientes a cuatro géneros, siendo Euphausia diomedeae la especie más abundante en los estratos 0-50 y 100-150 m, mientras que E. distinguenda fue la especie más abundante en el estrato de 50-100 m. Con base en modelos lineales generalizados con distribución quasipoisson se encontró que la abundancia del estrato de 50-100 m fue significativamente mayor que la del estrato de 100-150 m (t= 3.05, p < 0.05), sin embargo no se detectaron diferencias significativas asociadas con la hora del muestreo (diurna/nocturna) (t= 0.07, p= 0.94). Con base en la abundancia se construyó un índice de distribución vertical (IDV) encontrando que las especies de eufáusidos estuvieron concentradas en el estrato de 50-100 m durante el día y durante la noche. En los tres estratos de profundidad dominaron en abundancia las larvas calyptopis, seguido de las larvas furcilias, los juveniles y los adultos. Estos últimos incrementaron su abundancia gradualmente desde el estrato más superficial hasta el más profundo mientras que los juveniles tuvieron un patrón opuesto. Este es el primer trabajo que describe la composición taxonómica y distribución vertical y espacial de los eufáusidos asociados a la isla Malpelo, Pacífico colombiano.
       
  • Onthophagus landolti and Canthon indigaceus chevrolati (Coleoptera:
           Scarabaeinae) are attracted to the feces of ivermectin-treated cattle in
           the Mexican tropics

    • Abstract: Ivermectin (IVM) is widely used for parasite control in livestock in the tropics. Residual IVM in feces conserves its insecticide activity for weeks and can harm dung beetle (DB) species. Attraction to the feces of IVM-treated cattle was tested using the DB species Onthophagus landolti (Harold) and Canthon indigaceus chevrolati (Harold) as models. Experiments were done under controlled laboratory conditions, semi-controlled field conditions and uncontrolled field conditions. Olfactometers were used in the controlled and semi-controlled trials. The control treatment was baited IVM-free feces, and the experimental treatments were the feces of cattle treated with 1 % IVM (subcutaneous administration; single, 0.2 mg/kg bw dosage) and collected at 5, 14, 21 and 28 days post-treatment. The uncontrolled field trial involved pitfall traps baited with IVM-free feces or feces from IVM-treated cattle collected five days post-treatment. Under controlled and semi-controlled conditions, the feces of IVM-treated cattle (at 5, 14, 21 or 28 days post-treatment) attracted more O. landolti and C. i. chevrolati individuals than IVM-free feces (P < 0.05). The same response occurred under uncontrolled conditions. This clear attraction for IVM-containing cattle feces by the studied DB species highlights that incorrect IVM use may pose a risk to DB communities in cattle production systems.Resumen La ivermectina (IVM) es ampliamente utilizada para el control de parásitos en el ganado en los trópicos. La IVM residual en las heces conserva su actividad insecticida durante semanas y puede dañar diversas especies de escarabajos estercoleros. La atracción a las heces del ganado tratado con IVM se probó usando a las especies Onthophagus landolti (Harold) y Canthon indigaceus chevrolati (Harold) como modelos de estudio. Los experimentos se realizaron bajo condiciones de laboratorio controladas, condiciones de campo semicontroladas y condiciones de campo no controladas. Se utilizaron olfatómetros en los ensayos controlados y semicontrolados. El tratamiento de control consistió en heces exentas de IVM, y los tratamientos experimentales fueron heces de ganado tratado con IVM al 1 % (administración subcutánea, dosis única, 0.2 mg / kg pv) las cuales se recogieron a los 5, 14, 21 y 28 días después del tratamiento al ganado. El ensayo de campo no controlado incluyó trampas de caída libre o pitfall cebadas con heces libres de IVM y con heces de ganado tratado con IVM recogido cinco días después del tratamiento. En condiciones controladas y semicontroladas, las heces del ganado tratado con IVM (a los 5, 14, 21 y 28 días después del tratamiento) atrajeron más individuos O. landolti yC. i. chevrolati que las heces sin IVM (P < 0.05). La misma respuesta ocurrió bajo condiciones no controladas. Esta clara atracción a las heces de ganado que contienen IVM por las especies estudiadas pone de relieve que el uso incorrecto de IVM puede plantear un riesgo para las comunidades de escarabajos estercoleros en los sistemas de producción ganadera.
       
  • Seasonal microclimatic variation in a succession gradient of low thorn
           forest in Northeastern Mexico

    • Abstract: Global increase in land cover change and deforestation bring about fragmentation of a high proportion of native vegetation areas. Microclimate is among the first modified factors after vegetation loss, effects of such disturbances are critical for species performance. However, both secondary succession and seasonality provoke further modifications in abiotic environment after disturbances. Although microclimate patterns during succession are well studied for several ecosystems, they are practically unknown for low thorn forests. In Northern Mexico, this is an endangered ecosystem characterized by harboring a high percentage of endemics. Measurement of microclimatic factors is crucial for understanding possible consequences of post-disturbance time on species inhabiting this ecosystem. This work aimed to assess seasonal variation of microclimatic patterns in a succession gradient of four categories (conserved areas, 31, 17 and four years of succession). The study area was delimited using Landsat satellite images (1973, 1986, 2000, 2005, and 2013) in a fragment of low thorn forest in Northeastern Mexico. For microclimate characterization we studied wind speed, temperature, relative humidity, heat index, dew point, and evapotranspiration. Variables were measured monthly on eight plots, in each of the four successional categories, during two different seasons: wet (May through October 2016) and dry season (November 2016 through April 2017). A multivariate discriminant function analysis showed that microclimate differs among successional stages. In the wet season, early succession areas were characterized by higher values of heat index and wind speed, contrary to conserved areas. In the dry season, successional differences were attributed to wind speed and relative humidity. Moreover, microclimate differences between categories and importance of variables measured were both higher only during the dry season. Our results show that seasonality influences greatly microclimatic patterns during secondary succession. In addition, each one of the successional categories exhibited unique microclimatic conditions. Remarkably, four, 17, and even 31 years succession categories differed from conserved areas. This work provides evidence on the great relevance of seasonality and microclimate for studying secondary succession. It is suggested to take both factors into consideration when implementing conservation programs concerning endangered habitats such as low thorn forests. As an ecosystem poorly studied, microclimate characterization provided herein, shall help to a better understanding and management of these areas.Resumen El aumento global en el cambio de cobertura vegetal y la deforestación han fragmentado una elevada proporción de áreas de vegetación nativa. El microclima es un factor que se modifica después de la pérdida de vegetación, y los efectos de tales perturbaciones son trascendentales para las especies. Sin embargo, tanto la sucesión secundaria como la estacionalidad implican modificaciones adicionales en el medio abiótico después del disturbio. Aunque los patrones microclimáticos durante la sucesión son conocidos en varios ecosistemas, no se han evaluado en áreas de selva baja espinosa, que constituye un ecosistema amenazado en el norte de México. La medición de tales factores microclimáticos es crucial para comprender las consecuencias de la recuperación post-disturbio en las especies. Por lo tanto, el objetivo del estudio fue evaluar la variación estacional del microclima en un gradiente de sucesión de cuatro categorías (áreas conservadas, 31, 17 y cuatro años de sucesión), delimitadas mediante imágenes de satélite LANDSAT (1973, 1986, 2000, 2005 y 2013) en un fragmento de selva baja espinosa en el noreste de México. Para caracterizar el microclima se consideraron la velocidad del viento, temperatura, humedad relativa, índice de calor, punto de rocío y evapotranspiración. Las variables se midieron de forma mensual, durante un año, en ocho sitios de muestreo en cada una de las cuatro categorías sucesionales, durante dos estaciones diferentes: húmeda (mayo a octubre 2016) y seca (noviembre 2016 hasta abril 2017). A través de un análisis multivariado de funciones discriminantes, se determinó que las categorías sucesionales en la selva baja espinosa son diferentes dependiendo del microclima. En la estación húmeda, las áreas con poco tiempo de sucesión se caracterizaron por valores más altos de índice de calor y velocidad del viento, al contrario de las áreas conservadas. En la estación seca, las diferencias sucesionales se atribuyeron a la velocidad del viento y la humedad relativa. Además, tanto la discriminación entre categorías como la importancia de las variables fueron mayores solo durante la estación seca. Por lo tanto, la estacionalidad determina los patrones microclimáticos durante la sucesión secundaria. Además, cada categoría sucesional representa condiciones microclimáticas únicas, pero difieren de las áreas conservadas incluso después de 31 años de sucesión. De acuerdo con nuestros resultados, la estacionalidad y el microclima son de gran relevancia para el estudio de la sucesión secundaria. Se sugiere considerar ambos factores cuando se implementan programas de conservación de ecosistemas en riesgo, como la selva baja espinosa en el noreste de México. Al ser este un ecosistema poco estudiado, la caracterización microclimática que aquí se proporciona, ayudará a un mejor entendimiento y manejo forestal de dichas áreas.
       
  • Essential oil composition in natural population of Lippia origanoides
           (Verbenaceae) during dry and rainy seasons

    • Abstract: Lippia origanoides Kunth. is a medicinal shrub native to some countries in South America, Central America and the Caribbean. This study aims to investigate the chemical composition of the essential oil and the genetic diversity of a natural population of Lippia origanoides in two seasons. Leaf samples were collected from 30 individuals in the dry and rainy seasons. The essential oil was extracted into a Clevenger apparatus and analyzed by gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS). The relative quantification of thymol and carvacrol was performed by gas chromatography coupled to a flame ionization detector (GC-FID). Multivariate analysis was used to evaluate the genetic divergence between plants. Carvacrol was the major compound found in most plants for both seasons. In the rainy season, plant 15 presented thymol as the major compound, and plants 16, 27, 28 and 29 presented camphor as the major compound. In the dry season, thymol remained the main compound of plant 15 and camphor remained the main compound of plants 16, 28 and 29; however, plant 27 presented carvacrol as the main compound in this season. After carvacrol, the compounds with the highest content were γ-terpinene, p-cymene and methyl-ether-thymol. Of the 30 plants studied, only five differed in their chemical composition, showing some degree of stability in relation to the dry and rainy seasons. There was no variation in the main compounds between the two seasons, but there was chemical diversity among the main compounds. Tocher grouping revealed five distinct groups, with group 1 including most of the plants in both dry and rainy seasons, indicating that the time of year evaluated did not significantly interfere with the essential oil composition of most plants.Resumen Lippia origanoides Kunth. es un arbusto medicinal nativo de algunos países de Centro y Sur América y el Caribe. El objetivo de este estudio fue investigar la composición química de los aceites esenciales y la diversidad genética de una población natural de L. origanoides en dos estaciones. El aceite esencial se extrajo en un equipo de Clevenger y se analizó por cromatografía de gases acoplado a espectrometría de masas (CG-EM). La cuantificación relativa de timol y carvacrol se realizó por cromatografía de gases acoplado a un detector de ionización de llamas (CG-DIL). Se utilizó un análisis multivariado para evaluar la divergencia genética entre plantas. El carvacrol fue el compuesto principal encontrado en la mayoría de las plantas para ambas estaciones. En la estación lluviosa, la planta 15 presentó timol como el compuesto principal y las plantas 16, 27, 28 y 29 presentaron alcanfor como el compuesto principal. En la estación seca, el timol se mantuvo como el principal compuesto en la planta 15, de igual manera el alcanfor se mantuvo como el principal en las plantas 16, 28 y 29. Sin embargo, la planta 27 presentó carvacrol como el principal compuesto en esta estación. Después del carvacrol, los compuestos con el mayor contenido fueron γ-terpineno, p-cimeno and metil-eter-timol. De las 30 plantas estudiadas, solo cinco difirieron en su composición química, mostrando algún grado de estabilidad en relación a la estación seca y lluviosa. No hubo variación en los compuestos principales entre las dos estaciones, pero hubo diversidad química entre los compuestos principales. El agrupamiento de Tocher mostró cinco grupos distintos, con el grupo 1 incluyendo la mayoría de las plantas en ambas estaciones, lo cual indica que el periodo del año evaluado no interfiere significativamente con la composición de aceites esenciales en la mayoría de plantas.
       
  • Crustaceans (Decapoda and Stomatopoda) from the R.V. Skimmer and R.V.
           Victor Hensen in the Gulf of Nicoya, Pacific, Costa Rica

    • Abstract: Resumen El acceso a datos actualizados, sobre los nombres y distribución de las especies de crustáceos presentes en un área en particular, es un primer paso para evaluar cambios debidos a factores locales, regionales o globales, como la sobrepesca, la contaminación y el cambio climático. Los datos en este estudio están basados en las expediciones de los buques de investigación Skimmer (20 estaciones, 1979-1980) y Victor Hensen (1993-1994, 12 estaciones) en el estuario del Golfo de Nicoya. Los crustáceos fueron recolectados mediante redes de arrastre tipo Otter (Skimmer, malla 3.5 cm) y por tipos Otter y Beam (V. Hensen, mallas de 2.5 cm y 1.9 cm) a profundidades entre 10 y 228 m. Datos en dos estudios posteriores aportaron información para una zona de entre-mareas en la región superior del Golfo y para estaciones en la boca del estuario, lo que incrementa el ámbito de profundidad de 0 a 350 m. Se revisaron las publicaciones originales y se hicieron 32 actualizaciones de los nombres de las especies con base en la literatura reciente y en la página de red World Register of Marine Species (WORMS). El total de especies para ambas expediciones fue de 131, del que 119 fueron decápodos y 12 fueron estomatópodos. Los datos en los otros dos estudios, así como la revisión de las colecciones en el Museo de Zoología de la Universidad de Costa Rica, incrementó en 43 el número de registros, para un total de 174 especies en los sedimentos del estuario. Para el Skimmer el número mínimo de especies en una estación fue de cuatro (tres estaciones) y el máximo de 27, con un promedio de 12.3 especies / estación. Para el V. Hensen el mínimo de especies en una estación fue de ocho, con un máximo de 27 y un promedio de 17 especies / estación. Las especies presentes en 50 % o más de las 20 estaciones de la expedición del Skimmer, fueron: Callinectes arcuatus, Rimapenaeus faoe, Penaeus brevirostris, Achelous asper y Hepatus kossmanni. Para la expedición del V. Hensen las especies presentes en más del 50 % de las 12 estaciones, fueron: A. asper, Sicyonia disdorsalis, S. picta y Persephona subovata. Durante el estudio del Skimmer, un total de 15 especies fueron encontradas en solo una estación, mientras que para el V. Hensen el número fue de 26. Se digitalizaron dos matrices de datos de presencia-ausencia de las especies en las estaciones y con base en los nombres actualizados de las especies recolectadas por el Skimmer (57 especies x 20 estaciones) y V. Hensen (82 especies x 12 estaciones) se les aplicó un Análisis No Métrico Dimensional de Escala (NMDS) para obtener una distribución de las estaciones en un espacio bi-dimensional. Los resultados revelaron unos grupos heterogéneos de estaciones. Algunos sub-grupos de tres o cuatro estaciones concuerdan con su proximidad geográfica. Las cuatro estaciones del V. Hensen en la boca del estuario a profundidades mayores a los 60 m fueron separadas más claramente de las otras, y podrían indicar una transición, desde aguas estuarinas hacia aguas profundas, en la composición de la fauna de crustáceos. Evaluaciones futuras de la diversidad de crustáceos del Golfo de Nicoya deben de considerar la amplia distribución espacial de algunas especies y la restringida de otras. La variabilidad temporal es también importante en el estuario, tal como lo evidenció la oscilación de la población de Pinnixulala valerii en un periodo de tres años. The access to updated data on the names of the crustacean species and their distribution in a given area is a first step to evaluate changes due to local, regional and global factors such as overfishing, pollution, and climatic change. Data in this study are based on the expeditions of the RV Skimmer (20 stations, 1979-1980) and RV Victor Hensen (1993-1994, 12 stations) in the Gulf of Nicoya estuary. The crustaceans were collected by means of an Otter trawl (Skimmer, mesh 3.5 cm) and by Otter and Beam trawls (V. Hensen, mesh 2.5 cm and 1.0 cm, respectively) at depths from 10 m to 228 m. Data from two later studies were also included, one from an intertidal flat in the upper Gulf and the other from stations at the mouth of the estuary, which expand the depth range from 0 to 350 m. The list of species in the original publications were updated and 32 corrections were made based on recent literature and the web page, World Register of Marine Species (WORMS). The total number of species for both surveys was 131, of which 119 were decapods and 12 were stomatopods. Data from the other two studies and from the crustacean collection deposited at the University of Costa Rica Zoology Museum added 43 records for a total of 174 species collected in sediments from the estuary. For the Skimmer, the minimum number of species found in one station was four (three stations) and the maximum was 27, with an average of 12.3 species / station. For the V. Hensen, the minimum of species found in one station was eight, with a maximm of 27 and an average of 17 species / station. The species present in 50 % or more of the 20 stations of the Skimmer expedition, were: Callinectes arcuatus, Rimapenaeus faoe, Penaeus brevirostris, Achelous asper and Hepatus kossmanni. For the V. Hensen expedition, the species present in 50 % or more of the 12 stations, were: A. asper, Sicyonia disdorsalis, S. picta, and Persephona subovata. During the Skimmer survey a total of 15 species were found at only one station, while for the V. Hensen the number was 26. Two presence-absence matrices based on the updated names of the crustaceans collected by the Skimmer (57 species x 20 stations) and V. Hensen (82 species x 12 stations) were analyzed by Non Metric Dimensional Scaling (NMDS) to display the distribution of stations in a two-dime...
       
  • Influence of the configuration and heterogeneity of the agroforestry and
           silvopastoral mosaics on the bird community, Andean Amazon of Colombia

    • Abstract: General changes in land use have established patterns of modification of native vegetation into agricultural and grazing land. These production systems, as well as social and economic influences, have created diverse landscapes - mosaics composed of varied elements of vegetation cover (forests, crops, pastures, barren fields) that are distributed across spaces in different ways. In this investigation, we determine the distribution patterns of the richness, abundance and diversity of the bird community within the configuration and composition of agroforestry and silvopastoral landscapes. We observed 262 bird species, 6 720 individuals, 23 orders and 54 families within 39 production system mosaics. None of the species accumulation curves in the production systems reached their asymptote, and the calculated estimators predicted a greater number of species than those observed during the survey. In general terms, richness, diversity and equitability indices were highest in the mosaics of agroforestry systems, while abundance and dominance indices were highest in the mosaics associated with silvopastoral and traditional livestock systems. Variables that describe vegetation cover in mosaics have different and independent effects on the diversity of bird assemblages and on the association of land use groups within the mosaics. The positive extreme of the first component contributes to the variance in the model of richness and diversity indices - both the structural components of landscapes and biological components of the assemblages. The area and disposition of different types of elements in the mosaics of the production system landscapes reflect the systematic management of covers, which affects the implications of landscape conservation and restoration practices. Different landscape elements serve as points of contact in the dispersion and distribution of species within these landscapes. The priority of conservation efforts and the first step for the restoration and connectivity of landscapes in the Andean Amazon of Colombia should be the management and protection of covers like old stubble or BFG and BRP. Another approach is the design of landscapes for entire communities of species with respect to certain quantities of habitats in the landscape and the isolation of patches.Resumen La conversión generalizada de los usos de la tierra, han establecido patrones de modificación de la vegetación nativa a usos dominados por tierras agrícolas y de producción ganadera. La operación de estos sistemas de producción y las influencias sociales y económicas han creado diversos paisajes, mosaicos de elementos de cubierta vegetal variada (bosques, cultivos, pastizales, terrenos baldíos) dispuestos de manera diferente en el espacio. En esta investigación determinamos los patrones de distribución de la riqueza, la abundancia y la diversidad de la comunidad de aves en la configuración y composición de los paisajes agroforestal y silvopastoril. Se registraron 262 especies de aves, 6 720 individuos, 23 ordenes y 54 familias en los sistemas de producción. Ninguna de las curvas de acumulación de especies en los sistemas de producción llego a su asíntota y los estimados calculados predijeron un mayor número de especies de las observadas durante el muestreo. La variabilidad encontrada tanto de riqueza, diversidad como de dominancia y equidad en los ensamblajes de aves, entre los diferentes sistemas es explicada tanto por composición como por estructura. Las variables que describen la cobertura en los mosaicos, tienen un efecto diferente e independiente en la diversidad del ensamble de aves y de la asociación de los grupos de usos de la tierra en los mosaicos. Se presentaron correlaciones positivas entre los usos del suelo de vegetación abierta y los índices de dominancia, y los usos de suelo de vegetación cerrada con los índices de riqueza y diversidad presente en los mosaicos. Las aves responden a la variación de las coberturas de los elementos de los mosaicos en los sistemas de producción en esta extensión, sin embargo, es probable que a escalas más grandes se puedan estimar algunos otros patrones con relación a las variables de clase y paisaje seleccionados en esta investigación. Se pueden predecir cuales son los variables del paisaje más importante para todas las variables de respuesta en los paisajes de 500 m de radio.
       
  • Catharanthus roseus (Apocynaceae) naturally infected with diverse
           phytoplasmas in Costa Rica

    • Abstract: Phytoplasmas (class Mollicutes) are causal agents of plant diseases with an economic impact on crops or threatening local biodiversity. A survey was conducted from 2012 to 2016 on infected Catharanthus roseus plants that exhibited symptoms reminiscent of phytoplasma infection throughout Costa Rica. A total of 73 plants were collected exhibiting symptoms such as virescence, phyllody, axillary proliferation, little leaf, leaf malformation, chlorosis, or yellowing. All samples were tested by nested PCR using phytoplasma universal and specific primer pairs. Phytoplasma infection was detected in 52 (71.2 %) of the plants collected. Phytoplasmas of six subgroups belonging to 16Sr groups I, III, IX, XIII and XV were identified based on sequencing and in silico RFLP analyses. ‘Candidatus Phytoplasma asteris’ (16SrI) was the predominant group among the positive samples (n = 30) showing variety of symptoms and wide distribution from sea level to ca. 1 400 m.a.s.l. in six of the seven Costa Rican provinces. Group 16SrIII was the second most abundant (14 samples); and the remaining three groups were seldom found in C. roseus (8 samples). Moreover, group 16SrXIII phytoplasma was detected for the first time in the country. To the best of our knowledge, this is the first report of natural infection of C. roseus with phytoplasma subgroups 16SrI-B, 16SrI-P, 16SrIII-F, 16SrIX-F, 16SrXIII-A, and 16SrXV-B in Costa Rica and Central America.Resumen Los fitoplasmas (clase Mollicutes) son agentes causales de enfermedades de plantas que provocan pérdidas económicas o amenazan la biodiversidad local. Una recolecta de plantas de Catharanthus roseus que mostraban síntomas de posible infección con fitoplasmas se realizó en diferentes lugares de Costa Rica desde 2012 a 2016. Un total de 73 plantas fueron recolectadas con síntomas tales como viriscencia, filodia, brotación axilar múltiple, reducción foliar, deformación foliar, clorosis, y amarillamiento. Todas las muestras fueron evaluadas mediante PCR anidado usando los pares de imprimadores universales y específicos para fitoplasmas. Infección por fitoplasmas se detectó en 52 (71.2 %) de las muestras. Fitoplasmas de seis subgrupos dentro de los grupos 16Sr I, III, IX, XIII y XV fueron identificados basados en secuenciación del ADN y análisis de polimorfismos de restricción (RFLP) in silico. El grupo predominante encontrado en las muestras positivas (n = 30) fue el 16SrI (‘CandidatusPhytoplasma asteris’), éste mostró variedad de síntomas y amplia distribución desde el nivel del mar hasta casi los 1 400 m.s.n.m. en seis de las siete provincias de Costa Rica. El grupo 16SrIII fue el segundo más abundante (14 muestras); y los restantes tres grupos se encontraron en pocas muestras de C. roseus (8 muestras). Además, fitoplasmas del grupo 16SrXIII se detectaron por primera vez en el país. De acuerdo a nuestro conocimiento, este es el primer informe de infección natural de C. roseus con fitoplasmas de los subgrupos 16SrI-B, 16SrI-P, 16SrIII-F, 16SrIX-F, 16SrXIII-A y 16SrXV-B en Costa Rica y Centroamérica.
       
 
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